Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  70  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18337807--18337848
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1.96
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2.2
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22
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2.0
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25
1.83
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6.0
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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20
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1.98
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20
21
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1.98
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20
2.3
20
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30
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2.0
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1.98
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2.8
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18382426--18382662
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18382402--18382662
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80
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40
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2.0
23
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3.2
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
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1.98
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2.2
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63
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89
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214
34
18
10
35
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
18455194--18455277
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28
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1.20
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28
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18455281--18455432
9
15.9
9
69
20
69
61
2
4
30
1.29
18455289--18455332
21
2.1
21
95
0
79
68
2
4
25
1.20
18455281--18455391
19
5.8
19
76
9
93
62
2
3
31
1.26
18455299--18455390
37
2.4
39
75
17
93
61
2
4
31
1.27
18455469--18455493
6
4.2
6
100
0
50
16
0
0
84
0.63
18455615--18455731
10
12.3
10
72
12
79
29
2
1
66
1.14
18455604--18455641
19
2.0
19
90
10
60
26
2
5
65
1.27
18455606--18455648
19
2.3
19
84
8
52
30
2
4
62
1.28
18455615--18455685
21
3.5
21
76
3
58
28
2
1
67
1.13
18473800--18473878
39
2.0
39
100
0
158
40
16
10
32
1.82
18480247--18480378
44
3.1
42
75
15
126
28
28
18
25
1.98
18483310--18483467
40
4.0
41
86
8
195
27
20
26
25
1.99
18483310--18483495
40
4.7
40
84
7
186
26
20
26
25
1.99
18485453--18485612
29
5.5
29
81
1
151
25
15
33
25
1.95
18493453--18493632
40
4.6
40
88
2
258
22
20
30
26
1.98
18497818--18498003
40
4.7
40
86
7
220
26
22
26
24
2.00
18497848--18498022
80
2.2
80
80
8
196
28
21
26
24
1.99
18501107--18501281
46
3.8
46
77
13
205
23
21
27
27
1.99
18501102--18501273
93
1.8
93
94
0
308
23
22
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18504870--18504982
56
2.1
54
93
3
190
46
6
13
33
1.68
18504870--18505024
56
2.8
54
82
9
154
44
7
12
35
1.70
18506013--18506047
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
18513767--18513850
28
3.0
28
82
0
96
30
29
11
27
1.92
18513835--18513993
40
3.9
40
89
3
219
33
26
14
25
1.94
18513835--18514014
82
2.2
80
81
4
220
33
26
15
25
1.95
18517506--18517678
45
3.9
45
88
5
230
24
22
28
24
1.99
18517614--18517720
41
2.5
42
81
4
117
28
19
29
21
1.98
18520211--18520324
44
2.7
41
74
11
104
24
20
25
29
1.99
18520258--18520364
42
2.5
42
75
4
108
26
18
23
31
1.97
18526357--18526568
116
1.8
116
88
4
329
20
24
27
27
1.99
18526756--18527264
258
2.0
250
95
3
910
29
13
20
37
1.90
18530163--18530204
21
2.0
21
100
0
84
33
0
14
52
1.42
18531481--18531580
51
2.0
51
82
7
123
32
26
17
25
1.97
18537623--18537681
21
2.8
21
78
12
59
69
8
0
22
1.15
18539244--18539291
21
2.3
21
86
10
64
35
0
22
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1.54
18547002--18547106
54
1.9
54
96
0
192
39
9
14
37
1.78
18555225--18555288
29
2.1
31
83
11
80
35
0
3
60
1.12
18555266--18555290
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
18561998--18562167
46
3.7
46
70
14
143
22
19
27
30
1.98
18563838--18563882
24
1.9
23
86
4
63
24
8
20
46
1.78
18568042--18568105
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18568296--18568413
24
4.9
24
85
7
143
26
25
21
27
1.99
18568296--18568414
47
2.5
48
87
8
163
26
25
21
27
1.99
18568470--18568524
20
2.8
20
94
0
101
34
20
9
36
1.84
18571984--18572050
33
2.0
33
100
0
134
41
14
5
37
1.71
18577347--18577372
7
3.7
7
100
0
52
15
0
0
84
0.62
18577448--18577485
19
2.0
19
100
0
76
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10
26
31
1.90
18578387--18578426
19
2.0
20
86
13
57
77
2
5
15
1.04
18581797--18581848
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2.5
21
93
0
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40
13
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17
1.87
18585714--18585923
54
3.9
53
88
5
273
42
23
5
28
1.75
18585714--18585935
81
2.8
80
85
7
297
43
22
5
28
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378