Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2964566--2964621
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2.1
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2.1
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27
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.9
32
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3
86
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10
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2.0
18
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5.2
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1.96
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19
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1.9
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17
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0
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2.2
26
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3
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2.0
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2.5
23
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2
71
29
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31
35
1.75
3076900--3076949
23
2.2
22
85
3
64
30
2
32
36
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.67
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2
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2
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1
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13
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26
25
17
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1.97
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7.5
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9
156
25
24
18
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2.8
205
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0
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22
18
29
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2
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51
2
2
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1.26
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1
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45
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6
42
1.53
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2.5
19
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32
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2
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0
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0
50
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0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3133162--3133247
16
5.2
17
70
18
65
62
6
1
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1.28
3133155--3133199
16
2.9
15
78
18
56
62
6
2
28
1.33
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21
1.9
20
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5
60
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0
0
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0.92
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0
52
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0
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0
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0
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29
1.45
3136452--3136504
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2.9
18
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0
70
39
16
9
33
1.81
3137686--3137721
15
2.5
15
90
4
56
0
33
0
66
0.92
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3
13.0
3
94
5
71
35
0
0
65
0.93
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23
1.9
22
86
13
61
32
0
9
58
1.30
3142885--3143087
50
4.2
50
65
15
145
29
3
5
62
1.34
3142958--3142996
3
12.7
3
83
5
51
35
5
0
58
1.20
3142998--3143047
26
2.0
25
84
11
66
34
2
8
56
1.40
3142680--3143270
141
4.2
141
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5
881
29
4
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59
1.40
3143149--3143188
10
4.1
10
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3
55
37
0
10
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1.35
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16
3.0
16
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3
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36
0
6
57
1.24
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45
2.0
45
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0
158
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14
1.77
3155395--3155548
77
2.0
77
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0
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29
17
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30
1.98
3155680--3156000
64
5.0
63
69
18
207
28
17
21
32
1.96
3155459--3156013
194
2.8
195
93
2
963
29
17
20
33
1.95
3157744--3157817
3
24.3
3
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2
130
33
0
1
64
1.02
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3
14.7
3
90
4
72
35
2
0
62
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3157779--3158253
151
3.2
149
84
6
678
30
4
4
60
1.37
3162337--3162385
26
1.9
25
83
4
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26
4
2
67
1.19
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27
2.3
26
79
15
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35
6
1
56
1.35
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20
1.9
21
90
10
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42
5
0
52
1.23
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2.2
18
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2
0
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1.10
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2.2
21
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25
2
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1.27
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2.4
19
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42
0
2
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1.12
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9
5.3
9
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1.67
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2.6
18
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0
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27
6
14
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1.67
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2.0
28
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0
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1.24
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2.7
29
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26
17
33
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1.96
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29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
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15
2.0
17
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50
37
0
0
62
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31
2.4
32
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4
118
22
8
14
54
1.67
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18
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0
0
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2
14
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0.76
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2.9
16
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56
2
15
0
82
0.77
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15
2.1
15
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0
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32
9
0
58
1.31
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3.0
125
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20
24
20
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1.9
80
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203
34
21
23
20
1.96
3209956--3210028
33
2.3
30
80
11
83
56
2
5
35
1.37
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14
2.1
16
88
11
50
65
0
6
28
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3210248--3210497
3
80.0
3
78
12
188
61
5
2
30
1.32
3210973--3211008
11
3.2
12
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58
47
0
52
0
1.00
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3.5
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87
12
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13
0
6
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0.92
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11
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0
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2.0
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0
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1.9
72
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0
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373
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50
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18.5
2
94
0
65
48
2
0
48
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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