Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  87  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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11
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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25
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32
1.79
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94
3
218
36
25
5
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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307
24
22
27
25
2.00
23718911--23719037
14
8.9
15
68
8
52
43
38
0
18
1.50
23718904--23719023
21
5.6
22
66
9
59
44
37
0
18
1.50
23719008--23719052
14
3.1
14
87
3
63
46
33
0
20
1.51
23719005--23719053
15
3.3
15
85
5
64
46
32
0
20
1.51
23719630--23719757
40
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17
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20
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23719796--23719873
39
2.0
38
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2
102
25
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17
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23719704--23719894
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2.1
92
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24
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1.97
23722940--23723174
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15
25
1.96
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54
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0
364
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26
14
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1.95
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40
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1
112
29
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26
21
1.99
23726912--23727039
40
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39
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143
24
21
28
25
1.99
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24
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25
2.00
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1.9
80
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24
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2.00
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1.98
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23
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29
1.98
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2.1
12
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0
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49
2.7
49
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2
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21
28
22
28
1.99
23742331--23742503
49
3.6
48
80
6
151
23
28
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23746750--23746797
25
2.0
23
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8
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20
6
29
43
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2
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2
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0
0
50
1.00
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27
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10
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36
22
23
18
1.95
23753639--23753796
54
2.9
54
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2
221
36
22
23
18
1.95
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26
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0
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22
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1.96
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1
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1.9
175
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0
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25
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124
2.4
124
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0
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2.0
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0
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45
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178
3.3
178
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1
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88
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33
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22
22
1.97
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2.9
15
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28
6
0
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7
4
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1.44
23787341--23787386
19
2.4
19
85
7
58
21
17
13
47
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23791779--23791875
45
2.2
45
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3
124
31
17
22
27
1.97
23791755--23792344
178
3.3
178
90
1
889
31
19
22
27
1.98
23792324--23793069
88
8.5
87
84
2
877
33
21
22
22
1.97
23792696--23793022
44
7.4
43
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13
137
32
22
24
21
1.98
23793532--23793577
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2.9
15
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6
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28
6
0
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1
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0
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19
100
0
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25
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23815003--23815070
27
2.5
26
88
4
91
25
27
23
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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