Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Indices
Period
Size
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Score
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60
4
1
34
1.25
12872501--12872531
12
2.5
13
94
5
55
6
3
6
83
0.88
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22
3.2
21
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18
63
22
9
14
53
1.69
12875710--12875799
45
2.0
45
100
0
180
24
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15
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12875713--12875783
22
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22
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18
65
23
9
18
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12883774--12883822
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2.0
24
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28
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2
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2
100
0
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0
0
50
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27
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3
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62
1
0
35
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49
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26
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12893231--12893281
18
2.8
18
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0
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1
0
47
1.12
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2
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100
0
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0
0
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1.00
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0
0
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56
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0
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2.1
30
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120
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120
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0
1006
28
28
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27
1.95
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18
2.5
19
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17
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6
2
26
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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5
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0
2
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20
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0
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54
0
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0
0
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34
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51
0
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0
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2.5
19
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0
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2.1
23
92
0
80
46
4
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42
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12962286--12962317
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4.6
7
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0
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1.24
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2.1
16
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0
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4.1
9
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0
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0
0
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0
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0
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0
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6
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0
2
17
0.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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