Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  109  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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25
26
1.80
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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204
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204
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28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
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A
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(0-2)
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17
30
1.91
30399644--30399677
4
8.8
4
87
6
52
0
23
0
76
0.79
30399641--30399680
11
3.5
11
86
6
62
0
20
0
80
0.72
30405555--30406334
48
16.0
48
92
3
1173
35
6
28
30
1.83
30405871--30406039
60
3.0
60
76
19
236
33
8
30
27
1.87
30408301--30408660
127
2.8
127
81
4
404
38
16
15
30
1.90
30409344--30409441
27
3.7
26
77
8
90
58
5
4
32
1.39
30409617--30409745
3
42.7
3
71
13
68
61
4
6
27
1.40
30409660--30409754
27
3.3
27
70
18
75
66
7
4
22
1.34
30409686--30409762
24
3.2
24
69
12
61
66
6
5
22
1.35
30411122--30411173
3
17.3
3
100
0
104
67
0
0
32
0.91
30414464--30414573
25
4.4
25
96
2
195
38
21
16
23
1.93
30415185--30415314
67
2.0
66
96
1
242
24
22
21
31
1.98
30418333--30418473
40
3.6
40
88
3
198
19
27
24
27
1.99
30419065--30419094
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
30423735--30423789
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2.0
27
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69
7
16
7
1.35
30424709--30424810
47
2.2
47
83
3
125
23
18
22
35
1.96
30427204--30427354
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
30434709--30434859
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
30438779--30438914
26
5.2
26
95
0
236
34
4
23
37
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30440089--30440120
8
4.0
8
91
0
55
46
25
25
3
1.67
30440532--30440629
27
3.6
27
91
0
151
20
27
20
31
1.97
30440532--30440670
54
2.6
55
85
3
167
20
24
20
35
1.96
30442145--30442176
15
2.1
15
100
0
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68
6
6
18
1.32
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14
2.5
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11
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0
5
30
1.14
30444308--30444355
17
2.8
17
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14
55
62
10
0
27
1.27
30444309--30444355
20
2.3
20
77
0
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63
10
0
25
1.26
30453046--30453134
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2.0
44
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44
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43
1.48
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21
2.3
21
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3
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53
2
4
40
1.32
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30
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29
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107
42
0
0
55
1.11
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46
1
0
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1.07
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17
2.1
17
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57
2
0
40
1.14
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20
2.5
20
83
0
66
9
7
39
43
1.67
30478747--30478787
2
20.5
2
100
0
82
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0
0
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1.00
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2.1
16
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0
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1.49
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50
0
18
0
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0.70
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13
100
0
50
0
20
0
80
0.72
30481297--30481330
18
1.9
17
94
5
59
0
17
0
82
0.67
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22
2.4
24
82
5
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32
14
14
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30485006--30485051
20
2.3
20
85
3
67
28
21
17
32
1.96
30487555--30487613
30
2.0
30
86
0
82
23
27
25
23
2.00
30488694--30488833
48
2.9
48
93
1
228
29
23
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30491439--30491513
33
2.3
32
80
11
80
25
22
14
37
1.92
30493236--30493378
40
3.6
40
93
3
227
23
23
27
25
2.00
30501038--30501300
40
6.6
40
92
1
370
23
21
26
28
1.99
30513311--30513358
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
30513406--30513461
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
30513395--30513461
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
30513510--30513661
24
6.4
24
90
3
236
30
21
21
26
1.98
30513510--30513661
47
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47
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259
30
21
21
26
1.98
30513868--30513928
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2.0
31
93
0
104
32
16
26
24
1.96
30520459--30520522
32
2.0
32
100
0
128
50
9
3
37
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378