Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  45  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11199164--11199223
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1
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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18
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19
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1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
20
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5
60
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0
15
50
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11349728--11349777
3
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32
2
0
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2.1
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66
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4
2
60
1.27
11353148--11353195
19
2.6
18
83
9
53
68
2
27
2
1.11
11355039--11355093
20
2.8
20
85
0
74
20
34
30
14
1.92
11355983--11356012
7
4.4
7
91
8
53
30
26
0
43
1.55
11358094--11358125
16
2.0
16
100
0
64
50
6
6
37
1.53
11359495--11359539
23
2.0
23
86
0
63
55
0
2
42
1.12
11379218--11379307
17
5.0
16
70
17
54
64
2
3
30
1.22
11380592--11380637
15
2.9
15
87
6
56
28
6
0
65
1.17
11387788--11388217
133
3.2
133
88
1
603
31
19
21
27
1.97
11388166--11388441
45
6.2
44
72
12
195
30
19
22
28
1.98
11388056--11388546
179
2.7
179
86
3
670
30
19
21
28
1.98
11388230--11388525
89
3.3
88
71
14
255
28
19
22
29
1.98
11388543--11389076
88
6.1
88
87
3
690
34
21
22
21
1.97
11388963--11389208
130
1.9
132
84
3
336
34
19
20
25
1.96
11388676--11389234
44
12.8
44
69
12
294
33
19
22
23
1.97
11389777--11389848
35
2.1
33
82
7
81
23
18
5
52
1.66
11390248--11390314
15
4.5
15
78
14
68
29
7
0
62
1.22
11390246--11390314
29
2.3
29
77
20
72
28
8
0
62
1.25
11390279--11390324
15
2.9
15
90
6
65
26
6
0
67
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11392525--11392559
15
2.2
16
90
5
54
28
0
0
71
0.86
11402194--11402236
16
2.7
16
82
7
52
41
6
6
44
1.58
11404580--11404620
20
2.0
21
85
4
57
17
4
17
60
1.52
11406025--11406112
38
2.2
40
90
4
135
52
6
2
38
1.41
11408153--11408196
23
1.9
23
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0
61
29
2
2
65
1.16
11408664--11408706
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3.2
13
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27
4
2
65
1.25
11410086--11410128
21
2.1
20
86
4
59
55
2
0
41
1.12
11410086--11410142
27
2.1
28
83
9
73
54
5
0
40
1.23
11410159--11410188
15
2.0
15
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0
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50
0
0
50
1.00
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21
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17
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43
1
0
54
1.09
11411129--11411188
10
5.6
10
72
20
50
65
1
5
28
1.23
11411129--11411188
22
2.7
22
90
7
95
65
1
5
28
1.23
11413049--11413095
22
2.0
22
84
8
58
25
8
8
57
1.57
11413129--11413175
20
2.5
20
86
6
62
29
4
4
61
1.34
11413342--11413466
62
2.0
62
95
0
223
26
12
4
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1.52
11413371--11413442
37
1.9
37
81
10
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26
11
5
56
1.55
11425377--11426012
137
4.6
137
87
0
932
33
16
20
28
1.95
11425380--11426020
274
2.3
274
94
0
1111
33
17
20
28
1.95
11426291--11426426
26
5.2
26
92
0
227
33
5
24
36
1.78
11427900--11427952
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
11428201--11428483
134
2.1
135
94
2
496
24
17
25
32
1.97
11432167--11432301
26
5.2
26
93
1
227
33
5
24
37
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11432167--11432301
51
2.6
52
96
1
245
33
5
24
37
1.78
11433780--11433828
25
2.0
25
84
8
64
38
20
16
24
1.92
11434079--11434360
135
2.1
138
95
2
509
24
17
25
32
1.96
11435081--11435354
136
2.0
136
84
4
334
32
17
22
27
1.97
11437296--11437342
22
2.0
22
84
8
58
25
8
8
57
1.57
11437588--11437712
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2.0
62
93
0
214
25
13
4
56
1.54
11438601--11438695
29
3.3
27
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14
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31
7
2
58
1.37
11438653--11438726
19
3.7
19
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10
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27
5
4
63
1.34
11438578--11438701
57
2.1
60
83
7
157
29
7
3
60
1.39
11439249--11439300
22
2.4
22
100
0
104
46
9
7
36
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378