Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  104  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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21
28
28
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29
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.19
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2.0
25
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1.40
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2.3
23
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18
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22
2
72
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28814439--28814492
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22
2.1
22
95
0
83
36
28
4
30
1.76
28820010--28820062
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2.2
24
96
0
97
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15
0
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1.42
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46
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14
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22
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30
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28823965--28824135
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1.8
93
94
2
308
22
20
28
29
1.98
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2
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0
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0
0
50
1.00
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0
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29
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28839830--28839920
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12
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5
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29
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16
2.1
17
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25
0
22
1.48
28839988--28840025
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2.1
19
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21
1.47
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2
2
34
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2.8
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10
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2
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0
0
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0
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2
100
0
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0
0
48
1.00
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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36
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0
0
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0
0
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0
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5
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0
2
16
0.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28932994--28933029
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83
0
2
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0
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0
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0
0
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0
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2.1
35
97
0
137
31
10
15
42
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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