Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  284  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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61
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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19
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23
1.98
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1.9
21
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1.98
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199
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1.8
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26
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0
0
70
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18
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0
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29
8
25
36
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.2
134
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33
16
24
25
1.96
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5.5
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35
19
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1.65
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26
3.2
26
77
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34
19
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43
1.64
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1.9
21
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1.82
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2.6
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24
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1.98
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26
17
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25
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0
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29
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2.0
39
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1.78
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18
2.4
18
88
3
61
32
18
2
46
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85794592--85794722
27
4.9
27
85
2
176
35
15
22
26
1.93
85794582--85794722
54
2.6
54
91
3
214
36
14
21
26
1.92
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27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
85804949--85805017
11
6.7
11
77
14
76
36
11
18
33
1.87
85804961--85805017
20
2.8
20
100
0
114
36
10
19
33
1.86
85805065--85805134
25
2.8
25
91
0
113
24
25
24
25
2.00
85805116--85805161
25
1.9
24
82
8
58
26
23
23
26
2.00
85805337--85805477
31
4.5
31
89
0
201
30
16
25
27
1.96
85805337--85805516
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6.0
28
79
8
130
31
17
24
26
1.97
85808589--85809043
250
1.8
250
81
3
567
37
19
19
24
1.94
85814638--85814680
18
2.4
18
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70
34
20
0
44
1.52
85816546--85816671
40
3.2
39
80
6
139
21
25
24
28
1.99
85816485--85816671
80
2.3
80
78
12
204
22
27
24
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2.00
85824604--85824729
40
3.2
39
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6
139
21
25
24
28
1.99
85824543--85824729
80
2.3
80
78
12
204
22
27
24
25
2.00
85829223--85829268
19
2.3
20
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34
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4
52
1.52
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30
2.0
30
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0
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25
1.80
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0
15
47
1.45
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50
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5
310
26
17
25
30
1.97
85832090--85832484
151
2.6
151
91
0
630
27
17
24
30
1.97
85832245--85832426
101
1.8
101
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7
253
26
18
25
30
1.98
85832686--85832717
16
2.0
16
93
0
55
46
0
18
34
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
85842535--85842610
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
85842478--85842610
58
2.3
58
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2
133
24
17
33
24
1.96
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29
2.3
29
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0
87
33
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27
22
1.96
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29
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5
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21
16
33
29
1.95
85867475--85867577
29
3.6
28
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5
116
21
16
33
29
1.95
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2.3
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12
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1.93
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18
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1.50
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28
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24
1.99
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2.6
27
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0
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11
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0
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2.0
23
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0
0
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2.0
48
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115
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4.2
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23
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85908760--85908872
55
2.1
54
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156
16
22
23
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1.93
85911558--85911759
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2.1
95
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0
271
27
19
30
22
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19
30
22
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85912685--85912808
55
2.3
54
79
8
126
20
25
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85917205--85917245
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2.0
20
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0
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56
0
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69
2.0
71
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5
201
38
8
8
44
1.66
85917268--85917686
207
2.0
211
89
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39
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6
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1.61
85917482--85917730
138
1.8
135
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2
381
40
8
6
44
1.59
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2.1
27
100
0
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3
22
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85944500--85944524
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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