Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  271  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81439701--81439784
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116
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254
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0
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1.50
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3.0
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0
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59
0
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2.4
18
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4
11
13
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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0
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2.1
18
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440
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22
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1.89
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2.0
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59
48
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24
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2.3
21
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14
62
26
17
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
28
28
1.98
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3.9
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26
20
25
26
1.99
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21
1.9
20
84
5
51
30
0
2
66
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81584982--81585013
5
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96
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84
0
15
0
0.63
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2.1
17
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11
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39
0
6
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1.25
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27
5.2
27
83
6
171
34
21
24
19
1.97
81601991--81602149
54
3.0
54
90
2
232
33
20
25
20
1.97
81602009--81602152
54
2.7
54
93
2
236
34
22
25
18
1.96
81602205--81602636
215
2.0
214
98
0
837
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20
16
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1.95
81603982--81604037
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2.2
26
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0
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2.0
31
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7
4.3
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0
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60
0
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1.94
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2.8
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3
249
20
28
17
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1.95
81611510--81611541
2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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3.6
29
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0
143
25
33
15
26
1.95
81625114--81625274
29
5.6
29
92
0
250
26
32
14
26
1.95
81625056--81625274
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2.5
87
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2
235
26
33
14
25
1.94
81626551--81626580
14
2.1
15
93
6
53
0
10
0
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1.77
81629917--81630066
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2.0
76
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0
273
29
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21
1.94
81629917--81630111
76
2.6
76
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0
237
29
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1.93
81636678--81636751
37
2.0
37
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15
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24
8
25
1.82
81641638--81641752
31
3.7
31
97
1
214
27
26
17
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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42
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0
157
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20
15
31
1.94
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25
2.8
25
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4
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24
24
27
24
2.00
81643016--81643144
27
4.7
26
74
12
98
31
5
18
44
1.73
81642989--81643144
55
2.9
53
78
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152
32
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1.78
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27
5.7
26
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7
20
41
1.81
81643099--81643224
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2.3
54
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2
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1.83
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54
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10
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2.2
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1.83
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2.1
81
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28
1.82
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27
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218
39
7
24
28
1.81
81643256--81643431
54
3.3
54
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1
255
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2.1
81
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213
38
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1.83
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2
100
0
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51
0
0
48
1.00
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2.1
28
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25
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53
1.60
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21.0
2
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2
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47
1.14
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154
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4.7
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23
22
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25
20
28
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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25
25
2.00
81663647--81663852
80
2.6
80
81
3
209
25
23
25
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81667338--81667481
42
3.3
43
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152
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18
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32
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81667330--81667442
44
2.7
41
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11
129
25
16
23
34
1.95
81667330--81667486
86
1.8
85
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210
27
17
22
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1.96
81667295--81667475
43
4.2
42
73
8
132
27
16
22
33
1.95
81667338--81667494
43
3.7
42
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10
122
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1.97
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12
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23
1.83
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2.0
19
100
0
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89
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0
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21
2.0
22
82
4
54
40
25
0
34
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378