Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9.0
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2.1
31
85
5
87
52
4
6
36
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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15
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1.9
31
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10
20
22
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5501140--5501170
9
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0
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11
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61
1
0
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0
5
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1
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2.7
13
91
4
54
77
11
0
11
0.99
5507813--5507868
23
2.5
22
78
16
62
75
8
1
14
1.13
5511289--5511329
21
2.0
21
85
9
57
29
7
4
58
1.46
5522184--5522212
15
2.0
15
93
6
51
68
0
0
31
0.89
5523408--5523470
16
4.0
15
82
12
58
39
3
25
31
1.71
5529229--5529292
30
2.1
31
82
8
78
48
6
3
42
1.44
5537174--5537342
92
1.8
92
87
2
250
22
22
13
42
1.88
5537162--5537343
46
4.0
46
84
1
213
21
22
14
41
1.89
5539478--5539537
21
2.8
21
80
10
68
56
8
0
35
1.29
5544008--5544050
18
2.6
16
85
7
50
39
2
4
53
1.34
5552810--5552848
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
5553185--5553263
22
3.7
22
81
8
92
51
30
0
17
1.46
5553219--5553257
20
2.0
20
94
0
69
58
28
0
12
1.34
5555921--5556028
26
4.2
26
89
4
164
37
23
6
33
1.80
5557306--5557358
20
2.8
17
80
11
52
37
3
1
56
1.28
5557479--5557560
22
3.6
22
69
19
60
28
4
6
60
1.41
5557736--5557791
21
2.6
21
86
8
69
32
7
3
57
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5557703--5557821
59
2.0
62
81
8
147
31
6
4
57
1.44
5557869--5557899
16
1.9
16
93
0
53
32
9
0
58
1.31
5558198--5558281
27
3.4
23
77
19
80
33
5
5
54
1.49
5558207--5558269
23
2.5
26
75
17
69
34
6
3
55
1.41
5558569--5558631
22
3.0
21
76
19
51
31
1
6
60
1.31
5570753--5570889
73
1.9
73
92
3
231
31
19
21
27
1.98
5570808--5570987
87
2.1
87
91
4
292
26
18
18
36
1.94
5570967--5571074
54
2.0
55
90
5
175
31
14
14
38
1.87
5571494--5571540
22
2.1
22
88
0
67
38
38
0
23
1.55
5571502--5571564
22
3.0
21
77
9
56
49
34
0
15
1.45
5571758--5571808
22
2.4
22
86
3
68
33
5
3
56
1.42
5571886--5571916
16
1.9
16
93
0
53
32
9
0
58
1.31
5572350--5572385
19
1.9
18
88
5
54
38
5
2
52
1.39
5572567--5572631
23
2.8
24
80
11
66
32
1
6
60
1.31
5581240--5581283
22
2.0
22
100
0
88
40
18
13
27
1.88
5583645--5583680
18
2.1
18
90
10
58
36
0
5
58
1.22
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3
12.3
3
100
0
74
32
0
0
67
0.91
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26
4.2
26
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2
177
34
4
24
36
1.76
5593327--5593441
27
4.3
26
84
7
140
17
23
22
36
1.95
5593327--5593441
54
2.1
54
87
3
160
17
23
22
36
1.95
5596064--5596111
3
16.0
3
100
0
96
33
0
0
66
0.92
5596224--5596253
12
2.5
12
94
0
51
36
6
0
56
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5596768--5596838
25
2.8
25
77
10
65
33
11
4
50
1.57
5598358--5598467
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
5600081--5600219
27
5.2
27
86
4
174
17
24
22
35
1.96
5600081--5600219
53
2.6
54
88
4
192
17
24
22
35
1.96
5609846--5610083
72
3.3
72
90
2
374
23
5
15
54
1.63
5611262--5611331
35
2.0
35
97
0
131
34
5
21
38
1.77
5611513--5611551
12
3.2
12
81
0
51
28
7
38
25
1.83
5611938--5611996
19
3.1
19
90
7
84
55
0
0
44
0.99
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26
2.9
26
80
9
89
36
25
8
29
1.85
5612173--5612233
13
4.6
14
86
8
76
37
26
8
27
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378