Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  24  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6064692--6064723
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2.8
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20
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2.0
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2.0
21
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2
4
30
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
1
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6084354--6084423
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20
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1.24
6084371--6084430
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50
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13.0
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18
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6105285--6106245
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31
16
18
33
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15
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102
26
19
23
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26
3.8
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90
0
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2.2
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20
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2.0
25
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0
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16
22
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
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Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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6
18
1.33
6173584--6173696
36
3.2
36
76
10
101
55
0
8
34
1.37
6173721--6173752
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
6173856--6173898
16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
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3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
6174119--6174156
3
12.7
3
100
0
76
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0
0
34
0.93
6174635--6174685
24
2.1
24
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0
84
45
23
3
27
1.70
6174635--6174693
24
2.6
23
86
5
75
38
23
3
33
1.72
6174890--6174915
10
2.6
10
100
0
52
7
0
7
84
0.77
6175224--6175261
7
5.4
7
100
0
76
42
44
0
13
1.43
6178954--6179008
18
2.7
21
81
16
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69
3
3
23
1.21
6179276--6179393
59
2.0
59
98
0
227
38
8
5
47
1.58
6188838--6188895
16
3.5
16
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11
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39
0
0
60
0.97
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2
15.5
2
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0
53
48
0
3
48
1.17
6191002--6191034
14
2.4
14
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10
50
0
9
3
87
0.63
6191678--6192255
88
7.0
83
71
15
299
36
18
16
27
1.93
6191846--6191907
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
6192003--6192037
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6192055--6192585
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6.8
73
75
13
411
33
19
17
30
1.95
6192252--6192728
165
2.9
168
89
4
725
31
20
18
29
1.96
6192424--6192585
74
2.1
75
85
7
222
32
20
18
28
1.97
6192589--6192728
74
1.9
75
89
3
219
27
23
20
28
1.99
6192793--6192957
71
2.3
71
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6
244
41
21
15
22
1.90
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211
2.1
216
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7
610
35
21
17
25
1.95
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120
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119
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359
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14
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1.93
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22
1.89
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278
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22
15
25
1.93
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3.7
71
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4
356
37
22
14
25
1.92
6193233--6193496
71
3.7
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84
4
339
37
22
14
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2
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0
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0
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25
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15
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27
1.47
6201252--6201297
23
1.9
25
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8
69
6
8
10
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1.23
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14
2.4
14
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5
50
5
0
26
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1.13
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16
5.7
16
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18
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3
21
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1.16
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2.1
17
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10
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0
8
2
88
0.59
6201327--6201360
12
2.9
11
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8
50
0
8
2
88
0.62
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18
5.9
19
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12
163
38
11
14
36
1.81
6204282--6204388
35
3.0
35
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4
169
38
11
14
36
1.81
6210103--6210168
14
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13
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12
78
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0
12
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0.72
6210106--6210168
29
2.2
29
85
5
83
84
0
12
3
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6210106--6210161
7
7.9
7
84
11
78
83
0
14
1
0.72
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207
4.8
207
92
0
1538
30
17
22
29
1.97
6211407--6212406
413
2.4
414
90
1
1558
30
17
22
29
1.97
6212801--6212979
18
9.9
18
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37
10
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6212809--6212979
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35
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2
279
37
10
15
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6214194--6214302
43
2.5
43
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0
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27
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6217830--6217904
21
3.5
21
76
7
62
30
4
5
60
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378