Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  281  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84689085--84689302
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1.95
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2.5
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26
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1.95
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1.50
84747789--84747843
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2.5
17
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1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
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303
23
21
28
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1.99
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40
5.2
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20
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1.99
84770929--84771138
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302
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20
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1.99
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1.99
84788756--84788909
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3.8
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22
1.99
84793117--84793324
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303
23
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1.99
84801314--84801521
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5.2
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21
28
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1.99
84801310--84801521
80
2.7
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21
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18
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0
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157
34
21
25
18
1.96
84841474--84841614
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2.6
54
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212
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24
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1.96
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4.2
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162
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1.85
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141
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16
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1.96
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2.1
109
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2.5
28
88
2
97
30
14
28
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.9
48
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20
25
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1.99
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91
2.5
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19
24
29
1.98
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4.6
40
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24
29
23
1.99
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2.3
60
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165
30
20
22
25
1.98
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23
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87
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20
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1.96
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2.2
21
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25
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1.98
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22
28
18
29
1.98
84910834--84911044
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2.2
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28
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1.98
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1.54
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53
66
1
3
28
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84931409--84931508
28
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1.31
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3
4
29
1.30
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2.5
16
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41
2
0
56
1.13
84931761--84931823
27
2.2
30
86
11
87
41
1
0
57
1.08
84931783--84931824
19
2.2
18
87
8
57
42
2
0
54
1.13
84950624--84950677
25
2.2
25
83
3
65
62
7
3
25
1.38
84951029--84951068
16
2.5
16
83
0
53
37
15
15
32
1.88
84952497--84952566
35
2.0
35
97
0
131
20
8
15
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1.66
84954186--84954235
25
2.0
25
100
0
100
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20
28
1.79
84955467--84955498
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
84955467--84955497
14
2.2
14
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0
62
19
0
0
80
0.71
84962111--84962140
15
2.0
15
93
0
51
66
3
0
30
1.07
84964619--84964797
87
2.1
87
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0
313
28
21
18
30
1.97
84966393--84966447
27
2.0
27
86
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54
0
7
38
1.28
84966454--84966501
23
2.0
24
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11
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54
0
2
43
1.12
84967396--84967470
9
8.0
10
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18
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30
1
1
66
1.08
84967401--84967523
48
2.7
46
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7
205
30
2
1
65
1.15
84967447--84967480
11
3.2
11
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26
0
0
73
0.83
84967401--84967480
10
8.3
10
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20
55
30
1
1
67
1.06
84979455--84980175
44
16.2
44
77
6
524
32
15
21
29
1.95
84979455--84980175
133
5.4
132
77
5
639
32
15
21
29
1.95
84979454--84980141
311
2.2
310
80
6
723
32
16
21
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84981380--84981500
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2.6
45
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7
129
28
20
29
21
1.98
84987888--84987913
10
2.6
10
100
0
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11
26
19
1.85
84989185--84989441
48
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47
72
10
145
24
19
28
26
1.99
84991196--84991238
4
11.0
4
85
5
61
25
2
0
72
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37
2.0
37
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1
5
33
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20
10.1
18
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19
119
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1
4
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1.26
84992988--84993138
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157
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0
3
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1.20
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0
0
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84992984--84993138
18
8.1
19
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56
0
3
39
1.20
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5.0
38
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15
150
54
1
4
40
1.28
84992986--84993167
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3.1
56
75
13
156
54
1
4
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9
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15
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36
3
1
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84993400--84993512
10
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10
72
13
58
36
2
1
59
1.22
84993412--84993522
49
2.3
48
81
6
116
36
2
1
58
1.23
84993461--84993520
31
2.0
28
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75
36
3
0
60
1.14
84993393--84993512
59
2.0
59
82
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147
36
3
1
58
1.25
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2.1
49
81
5
118
35
4
0
59
1.19
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32
2.8
28
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32
3
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1.20
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9
19.4
9
69
19
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35
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1.22
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22
2.4
22
78
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35
1
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84995846--84995882
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2.5
15
95
0
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24
27
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39
4.5
39
90
2
257
30
28
22
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85009784--85009825
22
1.9
22
90
0
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42
7
0
50
1.30
85011623--85011665
22
2.0
22
86
8
63
53
4
0
41
1.21
85012034--85012121
44
2.0
44
88
0
131
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9
4
50
1.55
85013677--85013808
29
4.5
29
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1
246
24
24
14
37
1.92
85013677--85013808
59
2.3
59
97
1
248
24
24
14
37
1.92
85015660--85015747
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2.0
44
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0
140
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1.51
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2.0
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52
5
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13
1.9
13
100
0
50
64
4
0
32
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378