Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  245  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72894216--72894594
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0
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27
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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0
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20
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25
1.99
72989700--72989866
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2.1
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4.2
40
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2
185
25
27
21
25
1.99
72997706--72997872
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
72998696--72998741
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2.5
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1.99
73002801--73002950
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1.96
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27
21
25
1.99
73010800--73010950
80
1.9
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83
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198
24
27
21
25
1.99
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28
15
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1.95
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28
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108
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2.3
27
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88
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12
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34
1
1
61
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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15
5
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39
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2.0
20
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1.98
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2.3
18
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0
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21
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0
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0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73067843--73068057
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5.4
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6
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25
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2.00
73067856--73068050
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25
21
27
2.00
73081312--73081336
13
1.9
13
100
0
50
16
36
32
16
1.90
73081805--73081941
32
4.2
32
85
5
150
35
21
10
32
1.89
73081804--73081948
65
2.2
65
80
6
150
34
22
11
32
1.89
73088230--73088319
32
2.8
32
89
0
135
38
24
7
28
1.83
73091486--73091669
40
4.6
40
81
6
221
25
22
26
25
2.00
73091486--73091669
80
2.3
80
86
3
246
25
22
26
25
2.00
73094185--73094243
31
1.9
31
100
0
118
42
5
5
47
1.47
73098574--73098609
18
1.9
19
88
5
56
27
25
5
41
1.77
73100088--73100212
48
2.6
48
90
5
184
28
18
29
24
1.98
73100136--73100399
49
5.5
49
75
11
192
26
19
28
25
1.99
73116255--73116405
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
73116292--73116421
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
73124694--73124826
69
1.9
70
92
1
223
32
13
17
36
1.89
73126144--73126530
47
8.3
47
93
0
625
35
8
28
27
1.86
73131999--73132101
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
73135251--73135331
39
2.1
39
95
4
148
14
11
9
64
1.50
73135342--73135371
10
3.0
10
95
0
51
86
0
13
0
0.57
73135333--73135370
15
2.5
15
91
0
58
86
0
10
2
0.66
73136009--73136053
6
7.3
6
85
5
63
15
2
0
82
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73142625--73142791
39
4.3
39
90
3
255
31
21
26
20
1.98
73142625--73142817
78
2.5
78
87
2
237
30
22
26
20
1.98
73144267--73144396
40
3.2
40
86
4
183
24
29
23
22
1.99
73152247--73152302
24
2.3
24
93
0
94
17
12
19
50
1.78
73152263--73152302
12
3.5
11
83
10
53
17
10
17
55
1.69
73154145--73154251
42
2.5
42
84
0
151
28
34
21
14
1.93
73154145--73154268
42
3.0
42
81
2
133
25
33
23
17
1.96
73155359--73155431
26
2.8
25
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12
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32
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20
1.97
73158614--73158806
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2.1
91
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7
235
37
22
8
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1.85
73164411--73164436
11
2.4
11
100
0
52
84
7
7
0
0.77
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40
5.5
39
87
5
278
22
23
29
25
1.99
73173519--73173735
40
5.5
40
89
3
298
23
23
28
24
1.99
73178200--73178239
21
2.0
20
85
5
53
17
25
35
22
1.95
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40
4.8
40
90
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269
23
29
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1.99
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40
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322
24
28
23
23
1.99
73197945--73197982
14
2.9
13
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11
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18
13
10
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1.63
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26
3.6
26
72
16
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35
21
21
20
1.96
73200549--73200589
2
20.5
2
100
0
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51
0
0
48
1.00
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2.0
36
100
0
144
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5
5
25
1.38
73205212--73205236
7
3.6
7
100
0
50
0
40
0
60
0.97
73208746--73208771
12
2.2
12
100
0
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42
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23
1.81
73212897--73212947
19
2.6
20
84
6
68
66
11
0
21
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73220511--73220545
2
17.5
2
87
0
52
42
0
5
51
1.25
73220606--73220680
30
2.5
30
81
10
82
34
2
6
56
1.40
73225579--73225615
19
1.9
19
88
0
56
29
13
5
51
1.63
73225688--73225724
9
4.1
9
85
0
56
37
0
2
59
1.12
73225690--73225726
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2.1
18
94
0
65
35
0
2
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1.10
73225788--73225833
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2.0
23
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1.59
73225906--73225952
22
2.2
20
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10
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38
6
8
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1.60
73225974--73226027
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20
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11
0
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0
14
0
0.60
73237176--73237209
13
2.5
14
95
4
61
85
0
14
0
0.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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