Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14461573--14461645
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28
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22
1.90
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2.6
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2.1
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1.98
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1.98
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0
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2.4
21
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0
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20
36
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18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.0
26
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25
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2.0
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2.0
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14543390--14543454
32
2.0
32
96
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32
4
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2.0
26
85
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72
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20
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1.92
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2.3
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1
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20
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10
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2.2
26
96
0
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7
25
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
24
34
1.95
14558996--14559121
54
2.3
54
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0
207
16
25
23
34
1.96
14558996--14559154
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5.9
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78
10
148
17
24
22
35
1.95
14558996--14559136
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2.6
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192
16
24
24
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1.95
14560644--14560730
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2.3
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1.97
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20
24
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1.97
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1
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0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14591937--14591965
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0
0
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1.07
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5
10.6
5
76
19
51
74
0
1
23
0.91
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21
1.9
22
85
5
57
41
0
9
48
1.36
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29
2.1
28
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5
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21
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19
2.0
20
90
5
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46
17
0
35
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20
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24
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2.0
27
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92
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24
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33
2.0
34
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2
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71
10
5
11
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1.9
20
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0
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0
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1.88
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2
1.24
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1.94
14646277--14646379
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2.3
45
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26
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21
2.0
21
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0
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17
2
17
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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74
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22
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1.90
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2.0
24
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2
0
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1.12
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2.0
34
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3
0
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2.3
12
100
0
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7
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1.93
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127
3.2
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1.93
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64
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19
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28
1.97
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22
29
1.97
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2.0
224
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1.97
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224
2.8
222
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22
28
1.97
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4.2
44
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20
29
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224
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222
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21
27
1.98
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1.9
88
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0
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1.96
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2.8
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367
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2.2
125
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325
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17
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2.0
24
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4
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2.0
20
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13
100
0
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9
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44
1.46
14721084--14721130
21
2.4
19
82
10
58
46
23
2
27
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14731845--14731896
24
2.2
24
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70
21
1
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69
1.24
14734125--14734169
20
2.2
21
84
7
58
51
4
15
28
1.63
14740233--14740272
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0
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0
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2.2
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103
40
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3
53
1.34
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3.1
33
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1
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25
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29
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14745466--14745710
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33
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210
30
22
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0
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0
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4.3
27
84
4
112
27
11
19
41
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378