Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  47  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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25
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0
1
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
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0
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1
0
36
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
25
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98
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24
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21
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11853550--11853671
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2.6
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0
199
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34
1.90
11853720--11853775
11
5.5
11
71
16
57
32
19
12
35
1.89
11853823--11853870
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
11864776--11864842
34
2.0
34
100
0
134
29
20
5
43
1.76
11867708--11867765
30
1.9
30
86
6
82
24
32
25
17
1.96
11869245--11869286
21
2.0
21
86
9
59
33
23
11
30
1.91
11870875--11870966
17
5.5
17
72
13
66
66
2
27
4
1.22
11871642--11871691
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
11871631--11871720
21
4.2
20
72
24
67
68
4
0
26
1.08
11872692--11872739
18
2.6
18
76
3
51
39
12
12
35
1.81
11872728--11872774
24
2.0
22
84
8
58
44
6
14
34
1.71
11880621--11880798
49
3.7
48
80
8
211
22
29
20
26
1.99
11892315--11892476
35
4.6
35
81
4
193
30
12
25
31
1.93
11892572--11892632
31
2.0
31
90
6
97
22
19
31
26
1.98
11896953--11896980
5
5.6
5
100
0
56
21
0
21
57
1.41
11904311--11904343
13
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13
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4
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39
0
12
48
1.40
11905509--11905751
84
2.8
86
83
9
278
50
11
9
29
1.69
11907309--11907395
43
2.0
43
97
0
165
39
18
21
20
1.93
11908274--11908304
12
2.6
12
94
0
53
48
32
3
16
1.62
11909155--11909205
26
2.0
26
96
0
93
21
23
17
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11925921--11925982
27
2.3
27
77
5
63
46
4
1
46
1.33
11933030--11933067
19
2.0
19
85
10
51
10
21
18
50
1.76
11945158--11945477
46
7.0
46
94
0
516
22
23
15
38
1.92
11945462--11945509
23
2.1
23
100
0
96
35
27
12
25
1.92
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40
4.8
40
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3
217
22
27
23
27
1.99
11951347--11951518
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
11951340--11951515
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3.8
46
79
12
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28
29
21
20
1.98
11954136--11954197
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29
20
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1.72
11956032--11956077
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2.1
22
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19
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1.90
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2.4
33
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6
95
26
21
16
34
1.95
11956366--11956511
76
1.9
76
83
5
188
30
21
23
23
1.99
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18
2.1
18
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4
51
20
41
20
17
1.91
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17
1.9
17
100
0
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30
9
6
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1.56
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13
2.3
13
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5
51
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0
6
24
1.13
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2.0
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0
441
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15
1.9
15
100
0
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2.0
22
85
0
59
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11
20
16
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1.9
13
100
0
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0
0
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2.0
20
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41
0
2
56
1.13
11998188--11998229
9
4.6
9
77
16
50
45
0
2
52
1.13
11998185--11998229
19
2.4
19
82
13
58
44
0
2
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1.13
12002478--12002504
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12003295--12003319
12
2.1
12
100
0
50
24
28
8
40
1.83
12003827--12003920
31
3.1
30
69
18
79
28
14
7
48
1.71
12010797--12010873
4
18.8
4
76
5
64
5
25
3
64
1.31
12017171--12017273
47
2.2
47
84
3
145
36
21
16
25
1.94
12018083--12018115
4
8.2
4
93
0
57
3
24
0
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0.98
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0
13
0
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0.58
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2
100
0
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0
0
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1.00
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21
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0
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22
15
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1.95
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25
2.0
25
100
0
102
43
11
13
31
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378