Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  192  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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56613767--56613822
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1.99
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5.7
41
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288
25
26
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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39
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225
22
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1.99
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2.3
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54
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390
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56705155--56705502
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0
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24
21
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.78
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1.9
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100
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28
1.81
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27
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56751767--56751935
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84
26
6
18
48
1.72
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25
1.9
25
86
0
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33
25
16
25
1.96
56761629--56761687
20
3.0
20
97
0
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37
10
20
32
1.86
56761633--56761687
11
5.4
11
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16
55
38
10
20
30
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56761738--56761856
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
56761738--56761856
47
2.5
48
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170
28
21
22
26
1.99
56762048--56762111
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2.1
31
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0
101
35
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1.9
25
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0
69
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25
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56769732--56769790
20
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20
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109
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20
32
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56769736--56769790
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16
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38
10
20
30
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56769841--56769959
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5.0
24
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170
28
21
22
26
1.99
56769841--56769959
47
2.5
48
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5
170
28
21
22
26
1.99
56770150--56770213
31
2.1
31
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0
92
35
14
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25
1.93
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2
1334
26
9
10
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1.65
56774511--56774568
21
2.7
23
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25
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1.40
56774126--56774826
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308
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1318
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10
53
1.67
56774665--56774722
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2.7
23
76
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27
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1
62
1.35
56782842--56782956
54
2.1
54
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3
151
33
24
24
17
1.96
56782842--56782956
27
4.3
27
79
7
126
33
24
24
17
1.96
56783370--56783399
16
1.9
15
93
6
51
3
20
23
53
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56784572--56784681
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4.2
26
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2
177
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24
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34
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3
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0
100
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0
32
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1.9
93
90
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28
28
20
22
1.99
56788569--56788742
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3.8
46
77
11
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28
28
20
22
1.99
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21
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1.95
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5.7
40
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25
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28
1.99
56795862--56796059
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2.5
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24
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1.99
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18
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0
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2
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0
55
50
3
0
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1.17
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2.8
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34
22
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1.91
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18
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1.78
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1.85
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100
0
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0
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15
1.9
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52
5
0
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1.25
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1.97
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5.5
29
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4
171
26
16
30
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56822317--56822488
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3.7
45
77
11
127
22
30
19
26
1.98
56822372--56822540
46
3.6
45
76
10
135
21
30
20
27
1.98
56825197--56825393
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2.8
70
90
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17
29
20
1.96
56825231--56825393
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2.3
71
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1
310
33
17
29
19
1.95
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3.1
41
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32
17
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1.96
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2.3
71
100
0
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1.94
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299
12
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1.92
56844934--56845121
43
4.4
43
92
2
301
12
23
34
29
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378