Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  33  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8080747--8080788
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100
0
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2.5
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3.9
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2
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1.96
8105850--8105883
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1.9
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3.4
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2.4
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24
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3.8
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27
1.99
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1.9
79
83
6
194
22
26
23
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8153612--8153760
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3.8
40
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7
137
22
26
23
27
1.99
8153612--8153758
80
1.9
77
81
9
181
21
27
23
27
1.99
8161535--8161664
40
3.3
39
74
8
127
23
26
23
25
2.00
8161551--8161702
40
3.8
40
75
6
130
23
25
23
28
1.99
8164025--8164050
5
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5
100
0
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19
19
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4.1
9
92
0
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10
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8165159--8165191
9
3.7
9
84
15
50
42
24
9
24
1.83
8170628--8170675
20
2.3
20
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60
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8
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2.1
31
100
0
132
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9
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2.0
27
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227
2.0
227
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20
28
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2.8
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12
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1
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1.8
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20
1.98
8187836--8188011
46
3.8
46
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12
207
28
30
21
19
1.98
8197315--8197357
10
4.4
10
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13
54
51
6
0
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1.29
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2.0
24
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76
41
0
56
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1.11
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17
2.3
19
80
20
52
53
2
7
36
1.42
8216257--8216297
20
2.2
20
86
8
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43
4
2
48
1.37
8217260--8217306
21
2.3
21
96
3
87
34
4
12
48
1.61
8221421--8221471
25
2.0
25
88
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75
72
0
9
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1.9
30
82
3
71
57
21
3
17
1.54
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42
3.7
42
82
1
190
14
21
17
45
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
17
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24
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2.00
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21
2.6
21
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0
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18
25
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1.97
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10.8
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53
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4
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68
23
2
0
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1.00
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1.9
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10
152
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2.0
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22
12
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8323921--8323969
26
2.0
24
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0
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0
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13
65
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0
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0
5
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2.0
30
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0
104
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9
18
18
1.70
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37
2.1
37
100
0
154
32
20
15
31
1.94
8361229--8361303
19
4.3
18
76
10
75
36
2
1
60
1.20
8361495--8361537
22
2.0
20
86
8
59
30
6
4
58
1.45
8363483--8363514
16
2.0
16
93
0
55
37
18
3
40
1.67
8365318--8365375
29
2.0
29
96
0
107
50
10
8
31
1.67
8369629--8369682
20
2.7
19
73
18
56
51
3
7
37
1.48
8370820--8370877
23
2.5
22
83
5
62
25
3
0
70
1.03
8371070--8371108
19
2.1
19
100
0
78
38
5
15
41
1.69
8371364--8371402
5
7.8
5
97
0
60
41
12
0
46
1.42
8371447--8371489
17
2.5
18
81
7
54
34
2
6
55
1.39
8371595--8371632
2
20.0
2
84
10
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50
0
0
50
1.00
8372981--8373008
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100
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39
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0
1.54
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0
25
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8374065--8374110
23
2.0
23
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0
28
4
1.10
8374068--8374113
17
2.6
17
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3
56
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0
28
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1.10
8378384--8378420
19
1.9
19
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0
56
35
5
16
43
1.71
8380023--8380075
24
2.2
24
89
0
79
39
1
9
49
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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0
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14
19
34
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24
2.1
24
88
0
73
36
4
10
50
1.55
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22
2.9
21
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11
70
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3
1
28
1.17
8385106--8385159
21
2.5
22
85
8
67
64
3
1
29
1.21
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2
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0
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0
0
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39
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0
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0
0
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2.0
103
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27
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1.90
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0
0
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1.00
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2.0
20
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1.15
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2.8
18
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66
5
21
5
1.35
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2
20.5
2
100
0
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0
0
48
1.00
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19
2.0
20
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5
53
38
0
5
56
1.22
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23
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1.9
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33
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26
1.95
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105
2.2
101
79
10
247
33
15
25
25
1.96
8403763--8403841
33
2.4
32
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6
95
32
16
24
26
1.96
8411083--8411218
68
2.0
68
100
0
272
20
22
27
29
1.98
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19
1.9
19
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0
65
67
5
0
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1.12
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18
2.8
16
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70
2
0
27
0.99
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21
2.2
19
80
11
52
40
2
2
54
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8420331--8420378
19
2.5
21
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19
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4
2
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8420412--8420486
18
3.9
18
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19
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34
5
4
56
1.41
8420412--8420497
20
4.3
20
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19
65
36
4
3
55
1.37
8420594--8420677
42
2.0
42
81
9
100
34
2
5
57
1.36
8420625--8420666
16
2.6
17
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7
52
35
0
4
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1.19
8422275--8422330
27
2.1
27
100
0
112
28
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12
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1.92
8423440--8423491
27
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3.2
43
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4
0
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1.17
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3
41.3
3
68
13
69
26
6
5
61
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378