Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  246  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73238066--73238285
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1.94
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336
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2.3
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0
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20
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107
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2.3
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5
5
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2.6
27
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11
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77
4
5
12
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
73280482--73280589
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
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0
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20
22
20
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24
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1.9
101
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1.98
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2.5
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13
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1.94
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2.3
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2.5
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3.2
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266
28
18
28
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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144
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1.9
21
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0
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12
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1.91
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15
2.9
15
89
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13
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1.07
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22
2.0
22
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0
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36
22
22
18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73395685--73395755
35
2.0
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0
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11
12
33
1.79
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2.3
22
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37
2
0
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1.09
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0
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17
2.8
16
84
12
58
51
2
0
46
1.13
73403507--73403552
20
2.3
20
81
7
58
45
0
2
52
1.13
73406122--73406147
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
73407296--73407330
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
73409424--73409483
30
2.0
30
100
0
120
33
10
13
43
1.77
73409790--73409822
16
2.0
17
88
5
50
54
6
0
39
1.25
73410365--73410431
34
2.0
34
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5
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38
1
17
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1.59
73410423--73410464
22
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22
100
0
84
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0
14
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73410364--73410521
86
1.8
86
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2
264
39
1
17
40
1.61
73410451--73410517
34
2.0
34
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2
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1.67
73410562--73410615
22
2.5
22
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0
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0
14
40
1.46
73413804--73413927
49
2.5
49
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2
169
22
27
21
28
1.99
73415309--73415383
37
2.0
37
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0
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50
5
20
24
1.68
73418190--73418339
67
2.2
67
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8
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32
17
28
21
1.96
73418214--73418397
67
2.8
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29
17
29
22
1.97
73422705--73422835
29
4.5
29
93
4
212
26
25
13
34
1.93
73422705--73422835
59
2.3
57
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219
26
25
13
34
1.93
73422705--73422865
59
2.8
57
88
5
180
27
25
13
32
1.94
73422705--73422865
88
1.8
87
85
5
225
27
25
13
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73430606--73430764
30
5.5
30
87
8
213
27
25
13
32
1.94
73430606--73430764
87
1.8
87
86
2
230
27
25
13
32
1.94
73433454--73433600
41
3.6
41
85
1
215
19
23
28
27
1.99
73440199--73440344
40
3.7
40
100
0
292
26
23
29
21
1.99
73444042--73444251
40
5.2
40
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2
305
25
24
28
21
1.99
73452168--73452377
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
73456950--73457137
41
4.6
41
87
1
288
19
23
28
28
1.99
73456950--73457137
81
2.3
82
90
2
290
19
23
28
28
1.99
73458956--73459007
20
2.7
20
82
14
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38
23
0
38
1.55
73459873--73460030
29
5.4
29
86
1
192
25
14
31
27
1.95
73464514--73464645
18
7.6
18
68
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75
62
3
0
33
1.13
73464489--73464645
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3.0
52
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0
271
62
3
0
33
1.18
73465279--73465313
17
2.0
18
88
5
54
37
5
0
57
1.23
73471940--73471983
23
1.9
23
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9
54
40
2
4
52
1.34
73475388--73475537
37
4.1
37
93
0
246
26
30
20
22
1.98
73475788--73475910
22
5.3
22
65
24
74
25
29
13
32
1.93
73475742--73475935
47
4.1
47
93
0
307
26
27
11
34
1.91
73475810--73475936
25
5.3
24
66
22
81
28
28
11
32
1.91
73482115--73482417
48
6.5
48
77
10
222
29
18
28
24
1.98
73483562--73483600
21
1.9
21
89
5
62
10
35
30
23
1.88
73488424--73488597
49
3.5
49
82
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233
26
19
24
29
1.99
73488419--73488606
100
1.9
100
95
0
340
25
20
25
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73492023--73492196
38
4.5
38
86
2
224
31
24
22
22
1.99
73492023--73492212
76
2.5
78
84
3
249
30
24
22
23
1.99
73495346--73495473
39
3.2
40
81
7
156
22
25
28
24
2.00
73503331--73503460
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
73509899--73510028
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
73514047--73514212
46
3.5
46
79
8
201
27
17
30
25
1.97
73516555--73516648
33
2.9
32
80
10
93
24
22
26
26
2.00
73517656--73517727
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2.1
35
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41
11
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20
1.86
73519982--73520016
13
2.8
12
87
8
52
77
0
0
22
0.78
73520321--73520447
63
2.0
63
93
6
222
24
14
18
43
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378