Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  7  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2124154--2124258
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1.9
54
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0
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2.0
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2
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15
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0
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2.0
43
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1.93
2137746--2138114
88
4.5
77
77
10
281
29
17
17
35
1.93
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30
2.7
30
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9
20
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1.80
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26
3.0
25
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2
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1.14
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26
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5
91
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3
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1.19
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39
1.9
39
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5
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2
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2
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0
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2
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2.0
15
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0
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26
0
6
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1.16
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2.6
37
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20
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2.0
19
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0
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26
17
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2.8
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81
2
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25
18
23
32
1.97
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29
1.9
30
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10
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77
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5
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1.13
2147472--2147510
17
2.3
17
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17
10
0
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1.12
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29
2.0
29
82
6
71
22
10
7
59
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2148035--2148064
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11
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0
51
40
0
0
60
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12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
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1.77
2160785--2161303
72
7.2
72
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531
28
18
21
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1.97
2160798--2161290
143
3.5
142
90
3
697
28
18
22
30
1.97
2160792--2161305
215
2.4
213
82
6
585
28
18
21
31
1.97
2162130--2162186
29
1.9
30
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10
73
77
8
5
8
1.13
2162375--2162413
17
2.3
17
86
8
53
17
10
0
71
1.12
2162934--2162963
11
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11
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0
51
40
0
0
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17
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50
23
0
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69
1.13
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2.4
44
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144
29
23
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30
2.4
30
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2
79
32
20
21
25
1.97
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131
3.0
132
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3
446
33
20
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1.96
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13
1.9
13
100
0
50
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8
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20
1.65
2182017--2182115
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3.2
33
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26
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13
0
36
1.41
2182009--2182126
60
2.0
60
96
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218
52
13
0
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1.41
2182721--2182793
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2.0
37
97
0
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36
2
9
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1.49
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16
3.2
16
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10
59
41
3
21
33
1.72
2198438--2198587
39
3.9
38
88
2
185
30
17
6
46
1.72
2198438--2198587
78
1.9
77
86
4
212
30
17
6
46
1.72
2199199--2199238
21
1.9
21
84
0
53
35
35
0
30
1.58
2199775--2199830
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2.8
20
82
10
71
48
1
0
50
1.11
2199755--2199838
32
2.7
30
76
10
96
44
1
0
54
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2206672--2206760
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10
0
25
64
1.25
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3
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3
72
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3
1
65
1.18
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18
4.1
18
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12
82
30
3
1
64
1.20
2207073--2207165
26
3.6
26
72
10
82
29
3
1
66
1.14
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3
16.0
3
91
0
78
29
0
2
68
1.01
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132
1.8
132
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340
23
16
20
39
1.92
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22
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18
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5
19
0
75
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32
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15
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49
1.74
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1.9
26
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11
68
49
7
0
43
1.32
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1.9
20
94
0
67
7
31
0
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1.25
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2.4
38
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16
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3.1
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0
0
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14
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55
0
0
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1.9
20
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5
51
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5
12
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52
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15
9
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1.81
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1.9
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102
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1
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1.38
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0
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0
0
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2.1
15
93
0
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25
0
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70
1.02
2283629--2283694
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2.8
23
75
11
62
39
4
7
48
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2293263--2293297
18
2.0
17
94
5
61
57
0
0
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0.99
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17
2.0
17
88
0
50
35
0
0
64
0.94
2297576--2297613
20
2.0
20
94
5
69
42
10
0
47
1.38
2298005--2298085
33
2.5
33
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11
96
62
3
0
33
1.12
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76
1.9
76
91
0
238
34
6
10
48
1.63
2304100--2304174
19
3.7
19
80
7
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1
0
34
1.02
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14
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0
0
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0
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0
0
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23
2.4
22
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33
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0
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2314348--2314376
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0
0
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21
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0
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0
0
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17
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0
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20
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15
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0
0
59
0.98
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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2
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48
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2.0
62
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2
0
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1.9
20
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10
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0
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0
1
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2.0
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22
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427
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19
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0
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2.0
83
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24
26
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2.2
83
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26
24
27
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2413992--2414067
30
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29
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1.43
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2.2
31
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0
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0
0
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0
0
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0
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3.0
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50
1
1
47
1.16

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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