Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  372  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Score
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Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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46
1.13
111308786--111308841
27
2.1
27
100
0
112
48
10
0
41
1.38
111320260--111320381
61
2.0
61
100
0
244
34
19
21
24
1.96
111323479--111323629
53
2.8
53
88
6
198
26
15
27
29
1.96
111330976--111331126
53
2.8
53
89
4
214
25
16
27
29
1.97
111334542--111334664
25
4.9
26
71
21
86
33
5
0
60
1.20
111334540--111334706
8
21.9
8
67
21
83
34
5
0
60
1.20
111334540--111334589
5
10.0
5
75
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50
34
2
0
64
1.05
111334540--111334715
26
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26
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25
69
33
5
0
60
1.20
111334643--111334758
50
2.3
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34
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60
1.19
111344465--111344491
13
2.1
13
100
0
54
22
18
7
51
1.70
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1
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1
100
0
52
0
0
0
100
0.00
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13
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0
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35
7
21
35
1.83
111350499--111350563
29
2.2
28
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10
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50
1
0
47
1.10
111351193--111351298
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0
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1.79
111351688--111351736
12
4.1
12
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0
89
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2
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1.16
111351838--111351872
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0
54
0
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0
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0
0
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3
15.0
3
100
0
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0
0
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0.92
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33
2.2
30
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86
38
5
2
52
1.40
111354074--111354114
20
2.0
20
95
0
73
36
9
7
46
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111354310--111354684
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6.7
55
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3
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25
7
16
50
1.72
111354310--111354684
171
2.2
165
84
2
462
25
7
16
50
1.72
111356249--111356461
66
3.2
63
86
9
225
20
29
16
33
1.95
111356272--111356464
66
2.8
66
90
5
278
21
29
16
33
1.95
111356327--111356428
30
3.2
30
63
24
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20
29
11
38
1.88
111356267--111356532
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2.8
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21
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1.95
111363802--111364066
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3.9
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21
27
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1.96
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1.9
22
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0
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1.50
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19
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2
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1.11
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2.0
17
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48
0
0
51
1.00
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2.6
78
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2
218
28
19
18
32
1.96
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153
2.8
153
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394
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22
18
29
1.97
111374416--111374931
78
6.7
78
75
8
365
30
21
18
30
1.97
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5
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11
89
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0
0
20
0.72
111382643--111382697
9
5.9
9
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6
92
80
0
0
20
0.72
111382643--111382697
14
3.9
14
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15
78
80
0
0
20
0.72
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22
2.5
22
85
14
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30
3
1
64
1.22
111384559--111384635
19
4.1
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1
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1.26
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18
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29
2
4
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1.25
111399769--111399896
69
1.9
67
85
3
175
43
10
13
32
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111405070--111405216
75
1.9
75
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1
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44
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8
34
1.72
111406021--111406053
16
2.1
17
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11
52
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3
0
30
1.06
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130
2.6
133
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2
448
35
19
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28
1.93
111425331--111425380
3
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100
0
100
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0
0
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0.92
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188
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182
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0
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0
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2
7
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0
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0
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35
2.7
32
86
11
131
3
6
18
71
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378