Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  178  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51904874--51904992
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2.1
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21
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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1.96
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2.1
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189
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21
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1.97
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41
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98
32
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28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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2.3
71
100
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1.94
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25
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23
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39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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28
98
32
17
28
21
1.96
52114364--52114527
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
52121899--52122096
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
52121965--52122082
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
52121933--52122096
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
52123890--52123943
26
2.1
26
89
0
81
35
24
25
14
1.94
52124120--52124225
43
2.5
43
92
0
158
27
31
20
20
1.98
52124521--52124624
26
4.0
26
82
6
113
31
13
20
34
1.91
52124533--52124624
26
3.5
26
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5
114
31
14
18
35
1.90
52124522--52124624
52
2.0
52
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7
138
31
13
20
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1.91
52128086--52128161
34
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28
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21
27
1.99
52130837--52130889
22
2.5
20
74
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73
9
5
11
1.24
52131701--52131748
19
2.4
21
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6
64
66
6
4
22
1.32
52131787--52131835
18
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19
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9
66
69
0
4
26
1.06
52131714--52131824
3
35.7
3
71
16
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66
2
5
25
1.26
52135999--52136027
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1.9
15
100
0
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20
10
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1.68
52141300--52141424
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1.9
66
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5
180
32
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20
1.95
52148334--52148685
38
8.3
38
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21
209
29
16
24
29
1.96
52148368--52148664
47
6.7
47
76
13
315
30
16
23
30
1.96
52148411--52148685
85
3.2
85
95
0
487
30
16
23
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52150952--52151158
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5.2
40
90
2
303
23
21
28
26
1.99
52159015--52159178
40
4.2
40
82
8
187
23
20
29
26
1.99
52159015--52159178
80
2.1
80
84
5
212
23
20
29
26
1.99
52162383--52162424
15
2.8
15
88
0
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16
16
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38
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24
29
1.96
52164943--52165036
48
2.0
48
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0
161
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1.94
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203
28
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1.97
52164917--52165237
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3.8
85
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0
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1.96
52171944--52172129
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4.7
40
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26
27
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1.99
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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24
1.99
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2.7
39
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2
191
29
27
17
25
1.97
52179946--52180123
79
2.2
80
82
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213
27
27
19
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1.99
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2.0
20
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0
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2.0
20
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5
10
42
1.62
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19
2.0
20
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39
23
0
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46
2.7
46
91
1
198
30
26
21
21
1.98
52198168--52198309
46
3.1
45
83
7
128
29
27
21
21
1.98
52205427--52205464
19
2.0
20
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15
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39
23
0
36
1.55
52205693--52205814
46
2.7
46
93
0
199
29
27
21
21
1.98
52205691--52205833
46
3.1
45
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137
29
27
20
21
1.98
52207538--52207564
2
13.5
2
100
0
54
0
0
48
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52207767--52207814
17
2.8
17
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0
51
22
18
18
39
1.92
52209409--52209515
27
4.0
27
82
0
124
18
22
13
45
1.84
52209407--52209517
54
2.1
54
84
0
141
19
21
14
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1.86
52209550--52209619
27
2.7
26
75
4
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24
27
7
41
1.81
52212892--52212998
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15.7
7
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0
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1.20
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3.1
21
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61
0
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1.16
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29
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0
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0
0
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61
0
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52213019--52213049
16
2.0
15
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6
53
64
0
0
35
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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