Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  250  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
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237
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23
23
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1.99
Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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7
23
36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
C
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(0-2)
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134
82
7
369
31
5
24
38
1.78
74878322--74878656
91
3.7
91
76
9
279
31
5
24
37
1.78
74885386--74885443
30
1.9
30
86
6
82
27
37
24
10
1.88
74886064--74886105
21
2.0
21
90
0
66
21
0
4
73
1.01
74891440--74891567
48
2.7
48
90
0
193
36
7
25
30
1.84
74891451--74891594
48
3.0
47
84
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182
35
8
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29
1.86
74895927--74896038
42
2.7
42
82
0
134
27
13
26
32
1.94
74899658--74899704
19
2.3
20
82
10
60
36
0
14
48
1.44
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5.9
50
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2
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16
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30
1.97
74901987--74902041
22
2.5
22
100
0
110
14
30
29
25
1.95
74905009--74905038
16
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15
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33
23
0
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39
3.9
39
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0
216
23
30
21
24
1.99
74906736--74906918
78
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79
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1
269
22
29
22
24
1.99
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39
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39
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2
234
22
30
20
26
1.99
74914758--74914939
77
2.3
79
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23
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22
24
1.99
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0
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1.99
74923576--74923605
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0
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1.54
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50
6.5
50
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15
25
1.96
74929297--74929382
26
3.2
26
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4
136
29
19
13
37
1.91
74929308--74929560
26
9.6
26
81
8
217
22
15
21
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74929309--74929560
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4.8
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7
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22
15
21
40
1.90
74936176--74936228
23
2.2
23
80
6
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77
1
5
15
1.04
74936169--74936202
6
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6
52
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2
0
17
0.86
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27
2.5
28
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2
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28
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1.95
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3.0
27
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23
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1.93
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2.8
46
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1.97
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3.0
11
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0
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1.86
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1.97
74956640--74956810
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1.8
93
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21
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1.97
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2.2
26
100
0
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1.83
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2.2
26
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103
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19
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10
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1.80
74970025--74970132
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1.79
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13
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1.52
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27
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1.98
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30
2.5
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0
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1.97
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21
2.1
21
83
12
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9
4
20
1.40
74976327--74976369
22
2.0
21
86
4
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9
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20
1.40
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17
2.1
17
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0
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16
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2.0
21
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0
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70
2
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21
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13
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0
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19
2.0
22
85
14
59
32
47
2
17
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75009023--75009128
27
3.9
28
89
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139
34
21
25
17
1.96
75009016--75009130
54
2.1
54
87
3
160
35
22
24
17
1.95
75010747--75010856
26
4.2
26
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2
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36
24
4
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1.76
75014724--75014763
19
2.0
22
85
14
59
32
47
2
17
1.61
75014825--75014964
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5.2
28
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5
184
35
22
24
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1.96
75016582--75016691
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4.2
26
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2
177
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24
4
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1.76
75017805--75017870
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29
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6
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0.96
75017825--75017886
17
3.7
16
83
10
70
14
8
1
75
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378