Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  297  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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1.94
89887774--89887971
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258
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4.7
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1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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58
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195
24
21
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1.99
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139
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40
24
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90019582--90019678
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6
293
22
17
28
31
1.96
90024194--90024299
6
17.3
6
74
14
83
48
14
16
20
1.81
90024215--90024299
37
2.3
37
89
0
125
47
14
18
20
1.83
90024418--90024477
27
2.3
26
88
2
84
36
18
21
23
1.95
90024522--90024573
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
90024810--90025245
27
16.2
27
86
1
543
40
7
21
30
1.80
90025240--90025391
54
2.8
53
77
6
162
28
7
23
40
1.82
90025252--90025391
27
5.2
27
82
4
140
29
7
22
40
1.82
90026877--90026935
31
2.0
31
83
6
77
35
1
10
52
1.45
90028099--90028173
17
4.4
17
70
8
53
28
9
17
45
1.79
90028101--90028209
52
2.1
51
87
1
155
28
10
17
44
1.81
90028136--90028209
17
4.3
17
68
10
51
29
12
16
41
1.84
90029526--90029635
37
3.0
37
91
0
175
28
29
19
23
1.98
90029780--90029916
50
2.8
49
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6
206
31
26
5
36
1.80
90029887--90029987
47
2.1
47
85
0
139
27
29
10
31
1.91
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50
6.9
50
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4
279
25
17
27
30
1.97
90043434--90043778
151
2.3
151
87
3
489
24
17
26
30
1.97
90043543--90043728
101
1.8
101
82
4
241
24
17
27
31
1.97
90044340--90044702
180
2.0
180
86
1
512
38
9
19
32
1.85
90044852--90044960
36
3.0
36
98
0
209
15
30
8
45
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90068804--90068828
11
2.3
11
100
0
50
52
0
0
48
1.00
90072912--90073141
39
5.9
39
92
0
379
23
29
24
22
1.99
90076253--90076355
11
9.6
10
78
15
93
74
2
2
19
1.07
90076253--90076355
6
19.2
5
81
13
93
74
2
2
19
1.07
90076304--90076353
21
2.4
21
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3
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80
0
4
16
0.87
90076298--90076347
26
2.0
25
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82
80
0
4
16
0.87
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171
25
25
21
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1.99
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2.0
73
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25
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1.99
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2
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0
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0
0
50
1.00
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24
23
27
25
2.00
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4.2
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227
25
29
20
25
1.99
90098669--90098848
78
2.3
78
81
8
197
25
27
21
26
1.99
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27
4.9
27
78
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122
28
9
25
37
1.86
90117097--90117156
26
2.3
26
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2
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31
6
21
40
1.79
90117466--90117523
29
2.0
28
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9
73
29
31
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1.94
90120514--90120756
50
4.8
50
78
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233
24
18
26
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1.98
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16
2.1
16
94
0
59
32
17
29
20
1.96
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4.5
50
77
8
199
26
18
25
30
1.98
90133671--90133785
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133
21
10
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37
1.87
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34
2.4
34
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92
26
23
22
27
2.00
90142867--90143021
40
3.9
40
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8
181
22
28
24
24
1.99
90156141--90156310
45
3.9
45
80
6
170
25
25
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90162715--90162838
40
3.1
40
80
2
124
21
28
24
25
1.99
90174409--90174488
34
2.4
33
81
12
83
25
20
26
28
1.99
90178223--90178287
33
2.0
33
81
6
78
24
21
24
29
1.99
90181564--90181879
45
7.0
45
76
4
246
45
16
19
18
1.86
90185718--90185774
30
2.0
27
83
12
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33
5
1
59
1.30
90185806--90185873
26
2.6
26
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9
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29
1
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90185798--90185862
26
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28
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27
1
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0
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0
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0
0
50
1.00
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18
1.9
18
88
0
52
17
0
8
74
1.06

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378