Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  60  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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21
96
0
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
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0
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58
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10
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0
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223
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27
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.44
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2.7
27
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110
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15
24
1.44
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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A
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(0-2)
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22
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9
59
52
4
7
35
1.50
15476705--15476748
23
2.0
23
86
13
65
31
9
4
54
1.52
15479061--15479098
2
19.5
2
94
5
69
47
0
0
52
1.00
15480076--15480132
30
1.9
29
86
10
80
19
45
0
35
1.50
15480388--15480435
17
2.8
17
76
14
53
35
2
8
54
1.42
15481272--15481347
27
2.6
30
83
12
113
42
0
2
55
1.14
15481428--15481474
23
2.0
23
95
0
85
17
31
4
46
1.67
15481730--15481782
27
2.0
27
92
0
88
50
13
18
16
1.77
15482010--15482083
22
3.2
22
77
19
78
63
18
2
14
1.42
15482010--15482087
23
3.3
23
77
19
88
61
21
2
14
1.44
15484052--15484095
22
2.0
22
86
0
61
52
0
0
47
1.00
15484188--15484244
15
3.5
15
71
17
51
49
1
1
47
1.22
15484837--15484902
3
22.0
3
100
0
132
66
0
0
33
0.92
15485724--15485869
40
3.7
38
77
13
116
29
21
18
30
1.97
15486022--15486073
21
2.4
21
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52
26
0
25
48
1.52
15486136--15486232
7
13.6
7
74
11
63
19
0
36
44
1.51
15493341--15493400
21
2.9
21
84
0
93
3
1
35
60
1.23
15494218--15494279
30
2.1
30
88
11
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43
27
9
19
1.82
15494397--15494620
79
2.9
78
83
7
260
33
19
17
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15494423--15495134
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8.7
79
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15
393
35
18
17
29
1.93
15494710--15494769
30
2.0
30
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6
86
41
26
10
21
1.85
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494
2.1
492
96
0
1952
36
18
16
28
1.93
15494054--15495301
250
5.1
244
81
8
1379
35
18
16
29
1.93
15494972--15495449
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2.8
167
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2
706
31
19
18
30
1.96
15495306--15495571
76
3.7
75
77
16
212
29
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16
28
1.97
15495331--15495584
139
1.8
137
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5
377
28
24
16
30
1.96
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2.5
22
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3
0
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1.04
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1
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2.1
21
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0
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6
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1.24
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0
0
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10
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65
2
2
30
1.19
15520319--15520357
20
1.9
21
94
5
71
64
5
2
28
1.28
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7
3.6
7
100
0
50
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2.7
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17
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15
15
41
1.88
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27
4.3
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149
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23
23
16
1.94
15530886--15531000
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
15531101--15531152
26
2.0
26
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0
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1.97
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28
2.7
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4
88
30
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15532617--15532726
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4.2
26
92
0
184
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23
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2.0
22
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11
2.8
12
86
9
50
27
0
3
69
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15539284--15539346
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2.1
30
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0
117
57
12
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26
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15539375--15539423
22
2.2
22
81
0
62
61
10
10
18
1.55
15539725--15540012
96
3.0
96
97
0
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25
20
30
1.99
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1.9
31
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0
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13
10
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5.2
27
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23
21
1.96
15544804--15544944
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54
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176
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20
22
21
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100
0
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0
0
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1.00
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2.2
25
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71
0
26
1
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378