Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  263  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
119
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2.0
46
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0
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20
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24
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1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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4.6
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19
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1
23
4
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.75
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17
1.9
18
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5
52
67
0
17
14
1.23
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19
2.2
19
100
0
82
39
19
4
36
1.73
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14
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2
0
48
1.13
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16
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58
43
0
0
56
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0
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8
16
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75
1.02
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0
0
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0.98
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9
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9
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0
2
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1.08
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46
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22
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2
0
35
1.07
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19
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0
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13
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0
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0
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0
0
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0.67
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
2
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0
2
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2
0
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79137605--79137646
17
2.5
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17
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2
0
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22
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0
0
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19
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1.90
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23
0
0
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2.0
155
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3.2
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61
16
7
0
76
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79192192--79192244
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13
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4
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15
7
0
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0.99
79192216--79192244
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1.9
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100
0
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0
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1
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0
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2.1
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2.0
61
88
5
179
39
24
20
15
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378