Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  305  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indels
Score
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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147
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23
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
12
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41
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0
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10
17
1.12
92734490--92734825
126
2.7
126
90
0
519
29
17
16
36
1.92
92734868--92734911
16
2.8
16
86
13
56
54
34
0
11
1.36
92734894--92734944
24
2.1
24
85
7
68
56
25
0
17
1.41
92734840--92735224
161
2.4
161
89
3
569
41
23
3
32
1.70
92735191--92735260
8
8.4
8
75
20
63
52
34
0
12
1.40
92735192--92735261
16
4.2
16
82
10
88
51
35
0
12
1.40
92735191--92735261
24
2.9
23
79
12
79
52
35
0
12
1.40
92735249--92735286
16
2.3
17
90
4
60
60
21
0
18
1.36
92740014--92740092
28
2.8
28
86
0
104
34
11
25
29
1.91
92741666--92741696
13
2.4
13
100
0
62
22
16
54
6
1.64
92743190--92743230
18
2.3
18
100
0
82
41
0
17
41
1.49
92745059--92745249
40
4.8
39
78
8
172
22
28
24
24
1.99
92745099--92745249
78
1.9
80
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5
209
23
28
23
25
1.99
92754523--92754564
20
2.0
22
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9
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21
11
16
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1.77
92755474--92755631
30
5.3
30
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34
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29
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1.91
92761025--92761052
7
4.0
7
100
0
56
14
28
28
28
1.95
92773505--92773529
13
1.9
13
100
0
50
48
0
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1.50
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13
2.0
13
100
0
52
61
23
0
15
1.33
92783540--92783593
26
2.1
26
100
0
108
25
14
3
55
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92783873--92783933
28
2.2
29
80
14
74
50
1
1
45
1.21
92784816--92784880
25
2.9
23
82
15
75
66
9
0
24
1.21
92784842--92784880
19
2.0
20
95
5
71
71
10
0
17
1.12
92784844--92784886
19
2.2
20
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4
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79
9
0
11
0.95
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19
2.0
20
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4
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30
5
7
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1.48
92792837--92792870
17
2.0
17
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0
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0
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0
0
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0.96
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4.7
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0
0
26
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19
3.1
19
79
9
68
60
0
1
37
1.07
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2.1
29
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54
0
1
44
1.10
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29
3.6
28
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33
2
1
63
1.12
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1.9
38
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2
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37
1
1
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1.14
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9
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22
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31
2
1
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1.13
92814061--92814139
29
2.8
29
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11
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30
6
6
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2.1
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132
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10
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13
1.9
13
100
0
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4
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1.67
92816855--92816940
44
2.0
44
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4
111
46
13
11
27
1.78
92819220--92819299
31
2.6
31
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4
99
41
13
20
25
1.88
92819689--92819725
18
2.1
17
90
5
56
59
2
2
35
1.26
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20
2.0
20
100
0
80
15
30
20
35
1.93
92822519--92822623
27
3.9
26
82
5
120
20
22
21
35
1.96
92822519--92822623
54
2.0
53
84
5
140
20
22
21
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92823959--92824102
57
2.5
58
85
4
204
36
17
10
36
1.84
92825620--92825813
50
3.9
49
81
6
210
25
18
28
27
1.98
92827285--92827387
29
3.6
29
79
7
111
29
23
15
32
1.95
92832589--92832646
22
2.6
23
77
2
64
43
1
3
51
1.28
92841645--92842009
94
3.9
94
73
6
267
26
18
30
24
1.98
92841645--92842096
47
9.7
46
68
13
153
26
19
29
24
1.98
92841694--92842149
187
2.4
186
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3
632
27
19
28
24
1.99
92841694--92842099
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4.4
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298
26
19
29
24
1.99
92842375--92842517
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2.0
71
100
0
286
25
13
12
48
1.78
92843461--92843745
136
2.1
136
97
0
534
31
24
18
24
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378