Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  199  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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375
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4.3
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58751091--58751277
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2.2
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89
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288
34
28
19
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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58757143--58757270
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2.0
241
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23
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16
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2.4
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20
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32
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2.0
229
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16
32
1.91
58790483--58791276
302
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294
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1.92
58798617--58798666
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2.1
24
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22
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0
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0
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2.2
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10
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11
8
51
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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245
24
31
15
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1.96
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0
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2.0
22
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20
1.61
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96
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31
5
28
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58857134--58857332
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26
17
24
1.96
58875178--58875791
27
22.9
27
81
6
503
32
9
18
38
1.84
58875179--58875791
81
7.6
81
82
5
600
32
9
18
38
1.84
58876310--58876351
22
1.9
22
95
0
75
30
30
16
21
1.95
58879951--58880059
48
2.3
48
95
0
191
33
5
28
32
1.80
58880200--58880302
37
2.8
37
96
0
188
23
20
32
24
1.98
58892622--58892680
16
3.7
16
83
0
73
52
18
22
6
1.68
58892622--58892680
8
7.4
8
78
0
64
52
18
22
6
1.68
58892622--58892682
24
2.6
23
84
7
77
50
18
22
8
1.73
58892904--58892978
29
2.7
29
85
4
100
25
17
30
26
1.97
58899133--58899164
16
2.0
16
93
0
55
53
31
3
12
1.54
58906569--58906606
15
2.5
15
87
8
51
60
5
2
31
1.33
58907801--58907872
24
3.0
24
85
6
83
26
23
22
27
1.99
58907815--58907887
25
3.0
25
86
6
87
27
23
23
26
2.00
58907815--58907897
25
3.4
24
83
11
80
26
24
20
28
1.99
58908118--58908312
27
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27
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8
146
26
19
18
35
1.95
58908129--58908312
54
3.4
54
84
3
246
26
19
18
35
1.95
58908129--58908346
107
2.0
107
83
6
273
27
17
17
37
1.93
58908098--58908373
134
2.1
134
80
6
301
28
17
18
36
1.93
58908173--58908346
80
2.2
80
79
6
183
26
16
18
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58908145--58908373
107
2.1
107
81
6
259
27
16
19
37
1.92
58908198--58908429
27
8.7
27
81
7
154
26
13
21
39
1.90
58908358--58908461
27
3.9
26
78
5
91
29
7
21
41
1.81
58908309--58908456
54
2.8
54
78
3
129
31
8
18
41
1.81
58909668--58909704
17
2.2
17
100
0
74
43
18
5
32
1.73
58914496--58914702
40
5.2
39
83
4
200
24
26
23
26
2.00
58914511--58914703
80
2.4
81
82
1
244
24
26
22
25
2.00
58927905--58928066
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4.2
39
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5
247
24
19
32
24
1.98
58927905--58928097
39
4.9
39
88
1
244
23
20
31
23
1.98
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31
1.9
31
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6
77
61
1
0
36
1.06
58938061--58938160
38
2.9
33
77
18
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62
3
2
33
1.22
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19
2.6
19
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0
62
22
18
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44
1.85
58941718--58941766
19
2.5
19
86
3
62
71
2
24
2
1.07
58941715--58941766
12
4.2
12
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11
61
73
1
23
1
1.04
58941718--58941772
19
2.9
19
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58
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1
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1
1.09
58943779--58943895
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2.0
58
98
0
225
36
11
15
35
1.84
58943989--58944120
60
2.2
59
82
5
149
35
15
6
41
1.74
58946187--58946283
30
3.2
30
91
0
149
26
50
5
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1.67
58946838--58946905
25
2.8
25
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36
4
1
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58946919--58946980
25
2.7
23
79
16
74
30
4
6
58
1.44
58946919--58946992
25
3.1
23
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12
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29
5
5
59
1.42
58947043--58947098
25
2.3
24
79
14
62
37
16
3
42
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58948612--58948662
25
2.0
25
100
0
102
52
3
0
43
1.19
58948638--58948878
125
1.9
125
86
5
344
39
9
12
38
1.77
58958059--58958126
34
2.0
34
100
0
136
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26
14
35
1.94
58963287--58963517
50
4.7
49
81
4
284
29
26
17
25
1.97
58963287--58963516
99
2.3
99
85
3
302
30
26
17
26
1.97
58968184--58968445
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5.5
48
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14
210
27
18
29
24
1.98
58968181--58968356
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1.9
94
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4
266
28
19
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0
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2
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0
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3
0
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2.0
70
92
4
236
50
2
3
44
1.30

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378