Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
397987--398061
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32
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2.0
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2.0
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0
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0
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2.0
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2.1
23
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2.0
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0
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19
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1.9
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2
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2.1
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18
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11
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25
0
0
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0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7.5
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0
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461077--461136
24
2.5
24
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0
84
16
11
33
38
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2
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
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2.1
16
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1.50
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2.1
24
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1
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17
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120
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4
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2
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2.8
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2
1.12
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51
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0
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1.9
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2.1
34
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2.0
23
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22
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2.7
24
82
11
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2
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2.4
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59
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7
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2.0
75
98
0
293
33
12
13
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
238
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20
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115
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13
14
31
1.85
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2.5
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2.3
26
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19
61
37
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1.9
18
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11
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1.46
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2.1
96
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230
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19
20
29
1.97
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2.1
22
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11
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2
2
68
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0
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1.9
102
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2.0
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0
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0
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2.0
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0
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12
16
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2.0
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0
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117
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1
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21
15
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623524--623568
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2.0
22
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0
72
26
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0
71
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
623671--623708
21
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20
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10
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0
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627164--627195
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0
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0
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0.95
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2
12
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1.53
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12
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0
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0
1
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0
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0
0
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0.91
636710--636765
20
2.8
20
80
15
64
33
0
1
64
1.04
647847--647885
2
19.5
2
100
0
78
51
0
0
48
1.00
658764--658809
16
2.8
17
83
6
60
34
0
4
60
1.16
658772--658809
17
2.3
16
90
4
58
39
0
2
57
1.12
667439--667828
132
3.0
129
87
4
557
22
19
16
41
1.90
671578--671612
18
1.9
18
100
0
70
40
25
0
34
1.56
674646--674687
12
3.5
12
80
6
50
66
0
4
28
1.12
675544--675594
22
2.3
22
80
16
61
31
13
19
35
1.91
675672--675733
31
2.1
28
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14
72
38
9
4
46
1.58
678357--678675
171
1.9
171
92
0
539
40
16
17
26
1.90
683693--683726
14
2.4
14
95
0
59
23
0
5
70
1.09
684120--684159
20
2.0
20
85
0
53
55
0
2
42
1.13
688789--688815
13
2.1
13
100
0
54
29
7
22
40
1.81
692241--692514
46
6.0
46
93
0
424
39
15
22
22
1.91
700344--700511
57
2.9
57
92
0
282
17
27
22
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
702872--702935
29
2.2
30
97
0
105
39
20
4
35
1.73
704289--704456
57
2.9
57
91
0
282
17
26
22
32
1.97
705233--705265
16
2.0
17
94
5
59
39
0
24
36
1.56
719112--719167
20
2.9
19
75
19
53
75
5
12
7
1.18
719120--719179
30
2.0
29
84
9
77
76
5
10
8
1.14
724702--724812
44
2.5
44
97
1
206
22
19
14
43
1.87
729114--729142
5
5.8
5
100
0
58
17
0
0
82
0.66
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44
2.5
44
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1
197
23
18
14
43
1.87
734097--734300
30
6.8
30
83
3
185
28
28
21
21
1.98
734134--734302
90
1.9
90
82
2
214
30
27
20
21
1.98
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25
2.0
25
100
0
100
32
12
20
36
1.89
745457--745594
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2.0
69
86
6
194
27
17
26
28
1.98
747604--747698
30
2.8
34
75
22
92
53
6
0
40
1.26
748303--748370
35
1.9
35
93
0
118
29
19
11
39
1.87
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3
10.7
3
93
0
55
65
0
3
31
1.08
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40
2.0
40
100
0
162
33
34
0
32
1.58
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21
2.0
22
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13
61
11
26
14
47
1.78
780876--781770
377
2.4
374
83
5
1087
31
14
14
39
1.86
781821--781860
14
2.9
14
81
11
55
65
2
2
30
1.19
793840--793866
3
9.0
3
100
0
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0
0
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3
100
0
60
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0
0
33
0.92
802767--802818
20
2.7
19
81
3
59
61
5
1
30
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
802787--802838
26
2.0
27
88
3
79
67
3
0
28
1.08
803388--803419
16
2.0
16
93
0
55
12
28
6
53
1.62
817545--817779
78
3.0
78
92
0
380
29
24
23
22
1.99
818558--818933
192
2.0
189
85
4
515
22
11
18
46
1.82
820339--820410
31
2.3
31
83
4
92
30
1
13
54
1.48
820754--820879
35
3.2
41
83
14
185
34
13
9
42
1.77
823405--823514
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2.0
55
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0
193
39
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11
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1.9
123
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318
23
14
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9.3
6
94
0
58
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48
8
1.66
832613--832668
18
3.1
18
89
0
76
33
8
48
8
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378