Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  74  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
20
86
8
59
24
0
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1.22
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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221
29
18
19
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19822187--19822903
177
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27
1.98
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1
237
24
23
14
37
1.92
19833962--19834093
59
2.3
59
95
1
239
24
23
14
37
1.92
19835435--19835470
18
1.9
18
88
5
54
11
25
0
63
1.27
19836691--19836747
29
1.9
30
85
7
80
45
5
19
29
1.72
19841080--19841380
128
2.4
126
88
3
417
29
15
17
38
1.90
19844429--19844472
23
1.9
23
100
0
88
40
13
11
34
1.81
19856989--19857078
2
45.5
2
97
2
173
50
0
0
50
1.00
19865108--19865134
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
19868644--19868684
19
2.2
19
86
0
55
36
14
26
21
1.93
19868996--19869036
19
2.2
19
86
0
55
36
14
26
21
1.93
19868555--19869263
352
2.0
352
100
0
1418
36
14
19
29
1.91
19869281--19869309
10
2.9
10
100
0
58
72
0
10
17
1.11
19870510--19870543
2
17.0
2
93
0
59
47
0
2
50
1.16
19872899--19872945
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
19873206--19873555
46
8.0
46
83
11
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22
24
16
37
1.93
19873250--19873555
84
3.5
84
92
3
468
22
24
16
36
1.94
19873385--19873544
38
4.0
38
86
12
239
23
26
17
32
1.97
19876318--19876453
46
3.0
46
86
2
175
40
13
22
23
1.89
19876595--19876807
100
2.1
100
96
0
390
49
5
13
31
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19877993--19878064
3
23.7
3
97
2
135
66
0
33
0
0.92
19884946--19884978
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
19885024--19885086
21
3.1
21
82
10
78
20
0
6
73
1.05
19901610--19901640
11
2.7
11
95
5
53
90
0
9
0
0.46
19903123--19903151
12
2.4
12
100
0
58
75
0
24
0
0.80
19907810--19907845
15
2.4
15
95
0
63
36
22
22
19
1.95
19912051--19912103
16
3.3
16
86
5
63
15
20
0
64
1.29
19915637--19915694
27
2.1
28
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3
64
51
3
10
34
1.53
19920129--19920257
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
19921621--19921684
31
2.1
31
90
0
101
25
23
15
35
1.94
19921877--19921996
24
5.0
24
88
5
172
26
21
23
28
1.99
19922048--19922111
20
3.2
20
93
0
110
34
17
12
35
1.87
19922148--19922195
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
19923322--19923355
18
1.9
17
94
5
59
64
8
17
8
1.47
19930032--19930065
16
2.1
16
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0
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44
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29
1.79
19932070--19932109
21
1.9
21
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0
53
27
2
0
70
1.01
19932057--19932111
27
2.0
29
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7
78
30
1
0
67
1.01
19933519--19933544
12
2.2
12
100
0
52
42
15
0
42
1.47
19939038--19939112
30
2.6
29
76
17
75
62
0
1
36
1.04
19939589--19939686
18
5.5
18
89
4
146
36
13
11
38
1.80
19939589--19939695
35
3.0
35
94
4
178
37
14
10
38
1.80
19946893--19946926
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19955950--19955986
3
12.3
3
100
0
74
67
0
0
32
0.91
19956147--19956182
3
12.0
3
100
0
72
66
0
0
33
0.92
19956992--19957024
3
10.7
3
93
6
57
30
0
0
69
0.88
19957726--19957845
44
2.7
44
80
0
141
31
16
19
32
1.94
19958786--19958900
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
19958786--19958919
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
19960159--19960269
45
2.4
45
79
7
109
29
21
15
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1.94
19963294--19963508
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4.8
46
79
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209
28
30
20
20
1.98
19963348--19963461
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42
90
9
169
28
31
18
21
1.97
19965886--19965973
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378