Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  364  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.7
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4
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.1
33
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33
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51
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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43
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19
29
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109314150--109314345
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52
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28
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13
52
1.62
109314515--109314895
190
2.0
189
93
0
645
26
20
19
33
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100
0
70
31
0
0
68
0.90
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13
2.4
14
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14
52
0
11
14
73
1.10
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13
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14
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14
52
0
11
14
73
1.10
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11
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9
50
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4
0
50
1.20
109345122--109345153
7
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7
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18
0
0
81
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0
2
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0
2
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23
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0
44
1.29
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109350725--109350758
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0
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0
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109353844--109353940
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0
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91
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24
2.0
24
87
8
69
25
6
2
65
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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17
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0
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1.9
292
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2.1
19
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0
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0
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146
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28
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2.4
218
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1.9
117
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2
327
25
15
22
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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2.2
32
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2
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2
1.07
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1.12
109424165--109424250
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2.0
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37
17
17
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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