Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr01 113035596 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  64  of  378  ( 45343 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.54
Indices
Period
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Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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1.99
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23
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1.99
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162
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22
28
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16844180--16844288
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1.98
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1.79
16844455--16845009
287
1.9
286
95
1
1004
31
25
5
37
1.79
16851684--16851995
27
11.6
27
85
6
391
29
23
8
39
1.83
16851665--16852039
81
4.6
81
81
5
258
30
23
8
38
1.84
16853322--16853378
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
16853320--16853390
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
16853331--16853385
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
16853437--16853579
23
6.1
23
94
3
250
27
21
20
29
1.98
16853436--16853601
23
7.0
23
90
4
235
28
21
21
28
1.99
16853437--16853601
47
3.5
46
90
6
251
27
21
21
28
1.99
16862077--16862104
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
16867932--16867956
11
2.3
11
100
0
50
44
8
16
32
1.76
16869317--16869361
22
2.0
23
95
4
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22
17
4
55
1.60
16875553--16875597
7
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7
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5
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28
0
0
71
0.87
16876936--16876967
2
16.0
2
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0
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0
0
50
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1.92
16889905--16889962
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2.5
23
77
8
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44
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5
46
1.42
16890713--16890778
32
2.1
32
100
0
132
37
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19
18
1.93
16891161--16891187
14
1.9
14
100
0
54
51
14
7
25
1.68
16891426--16891450
12
2.1
12
100
0
50
72
0
16
12
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16897272--16897305
9
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9
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0
50
85
0
14
0
0.60
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14
3.6
14
72
11
55
52
4
2
41
1.32
16900275--16900362
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2.2
40
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4
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39
1
15
43
1.55
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5
7.0
5
100
0
70
40
0
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1.52
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20
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16916085--16916244
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2.3
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209
41
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15
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2.0
20
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0
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0
0
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96
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30
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1.92
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2.2
16
90
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83
0
13
2
0.76
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13
2.8
13
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4
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42
0
13
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1.43
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2.0
20
90
0
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20
5
5
70
1.26
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20
2.2
20
100
0
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4
13
27
1.60
16941142--16941173
16
2.0
16
93
0
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12
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1.87
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19
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2
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2.0
23
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46
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5
235
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14
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16963211--16963303
30
3.1
30
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0
168
21
13
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7
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7
100
0
50
12
56
0
32
1.36
16974586--16975051
233
2.0
233
100
0
932
34
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10
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16977468--16977518
25
2.0
25
96
0
93
43
9
11
35
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16977732--16977828
48
2.0
48
100
0
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19
10
28
1.84
16978566--16978683
45
2.6
45
82
2
139
27
21
14
36
1.92
16980210--16980245
14
2.6
14
90
0
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55
5
0
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39
2.0
39
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0
149
37
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20
22
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10
5.0
10
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2
2
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1
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2.0
20
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66
0
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19
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0
0
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55
0
1
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1.10
16983995--16984037
12
3.6
12
87
0
68
27
2
4
65
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378