Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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135
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499
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2002
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565
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2.2
40
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21
23
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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0
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10992898--10993044
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3.2
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1
161
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21
24
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20.0
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20
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20
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4.0
24
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10
124
28
21
24
26
1.99
11015349--11015442
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2.0
49
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133
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21
24
26
1.99
11015634--11015796
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4.4
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22
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11015658--11015773
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3.5
31
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142
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20
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2.0
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16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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21
24
26
1.99
11023702--11023795
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2.0
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21
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26
1.99
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4.4
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232
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22
1.93
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3.5
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23
1.89
11023987--11024126
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2.0
69
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21
23
1.92
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27
1.97
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13
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4
0
46
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11080911--11080939
2
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2
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18
20
35
1.95
11082785--11082877
31
3.1
30
74
10
82
41
5
25
26
1.77
11084435--11084487
22
2.4
21
78
15
54
16
15
0
67
1.23
11089855--11089909
18
3.1
18
83
0
74
38
16
25
20
1.92
11093282--11093321
21
1.9
21
89
0
62
27
32
17
22
1.96
11093664--11093928
131
2.0
131
98
0
512
29
18
9
41
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11098118--11098176
28
2.0
30
83
6
77
35
0
5
59
1.20
11098321--11098374
18
2.8
20
75
16
60
33
1
0
64
1.04
11099185--11099218
14
2.3
15
85
10
52
38
0
8
52
1.33
11099672--11099697
11
2.4
11
100
0
52
34
0
0
65
0.93
11100552--11100582
16
1.9
16
93
0
53
19
3
0
77
0.90
11101329--11101380
26
2.1
26
92
7
90
51
9
23
15
1.72
11106207--11106347
2
70.5
2
100
0
282
0
0
49
50
1.00
11111105--11111135
15
2.1
15
100
0
62
25
0
0
74
0.82
11111716--11111799
31
2.7
31
83
1
98
42
9
9
38
1.70
11120773--11120812
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1.9
21
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0
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35
0
17
47
1.48
11123053--11126045
749
4.0
744
94
1
5283
37
11
17
32
1.87
11131508--11131620
49
2.4
47
82
5
138
27
14
21
37
1.92
11133434--11133471
15
2.5
15
87
8
51
21
34
5
39
1.76
11135102--11135126
11
2.3
11
100
0
50
24
8
16
52
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11141281--11141335
26
2.1
26
83
6
67
45
0
1
52
1.11
11141286--11141343
5
10.8
5
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12
62
43
0
1
55
1.10
11141287--11141344
8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
11141289--11141344
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
11142659--11142697
18
2.1
19
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4
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41
0
10
48
1.37
11142937--11143071
39
3.4
39
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24
20
27
28
1.99
11143194--11143234
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
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2.0
45
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0
171
42
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25
1.87
11152105--11152175
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2.0
36
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0
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28
7
19
45
1.76
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34
2.9
35
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6
121
33
5
14
46
1.66
11152829--11152911
17
4.9
17
83
2
96
34
4
15
44
1.68
11152849--11152934
17
5.2
16
74
18
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31
5
15
47
1.68
11155915--11155958
20
2.3
19
88
7
63
6
4
43
45
1.51
11157608--11157847
96
2.4
95
81
13
252
39
1
18
40
1.60
11157781--11157810
15
2.0
15
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0
51
16
0
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1.47
11157601--11157841
104
2.4
95
80
13
254
40
1
17
40
1.59
11157884--11158304
126
3.3
126
87
2
621
33
17
21
28
1.96
11161318--11162046
116
6.3
116
94
1
1239
47
9
3
40
1.53
11162431--11162473
18
2.4
18
88
7
61
46
11
25
16
1.80
11162529--11162585
30
1.9
30
85
7
80
10
19
40
29
1.85
11163090--11163116
7
3.9
7
100
0
54
59
14
0
25
1.36
11163082--11163115
14
2.4
14
90
0
50
64
8
0
26
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11164217--11164247
15
2.1
15
93
0
53
67
0
9
22
1.19
11164263--11164306
22
2.0
22
82
8
54
43
2
25
29
1.67
11169282--11169334
26
1.9
27
81
11
63
50
0
7
41
1.30
11169474--11169504
6
5.2
6
100
0
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48
0
0
51
1.00
11171417--11171446
14
2.1
14
100
0
60
0
13
0
86
0.57
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3.5
41
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20
119
26
18
21
33
1.96
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5.4
49
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19
170
26
18
18
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1.94
11175633--11175936
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3.3
92
90
0
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27
17
19
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1.94
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1.9
68
81
0
159
27
25
20
26
1.99
11187760--11188016
132
1.9
132
84
1
345
37
19
15
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378