Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  80  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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1.9
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1
10
61
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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259
29
26
18
25
1.98
21606655--21606884
100
2.3
101
81
3
261
29
26
18
25
1.98
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2.0
27
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22
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26
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24
3.4
24
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33
20
21
24
1.97
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24
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92
35
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23
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2.0
19
100
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25
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147
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1.98
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2.1
136
95
0
509
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24
19
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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93
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8
0
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19
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23
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0
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25
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0
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10
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
5
43
1.73
21704463--21704560
23
4.3
23
88
2
137
36
24
23
15
1.93
21704503--21704570
23
3.0
23
86
0
64
39
22
20
17
1.92
21704840--21704931
44
2.1
44
85
0
121
31
22
20
25
1.98
21711075--21711144
25
2.8
25
70
20
65
58
7
5
28
1.48
21712982--21713041
26
2.4
24
86
8
84
68
1
0
30
0.99
21712998--21713070
21
3.1
24
79
15
64
68
5
0
26
1.11
21713012--21713070
21
2.8
22
85
7
70
69
5
0
25
1.09
21713116--21713148
15
2.1
16
88
11
50
69
0
0
30
0.88
21728378--21728415
14
2.9
13
81
11
51
18
13
10
57
1.63
21749482--21749515
17
2.0
17
94
0
59
55
0
5
38
1.24
21750652--21750807
48
3.3
48
86
5
210
25
12
29
32
1.93
21750654--21750790
71
1.9
72
86
1
195
25
12
29
32
1.92
21750652--21750807
24
6.5
24
83
4
183
25
12
29
32
1.93
21750652--21750807
71
2.2
72
82
5
192
25
12
29
32
1.93
21750677--21750832
24
6.5
24
80
5
79
24
13
30
31
1.93
21754407--21754440
17
1.9
18
88
5
52
50
5
5
38
1.51
21754422--21754472
23
2.2
23
100
0
102
43
3
3
49
1.39
21759139--21759186
19
2.5
19
86
0
69
18
29
31
20
1.97
21761071--21761423
46
7.5
47
76
11
289
22
28
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21761071--21761426
94
3.8
93
83
7
402
23
28
18
29
1.98
21761071--21761329
140
1.8
140
83
5
344
22
29
18
28
1.98
21770848--21770873
7
3.7
7
100
0
52
26
0
0
73
0.84
21771109--21771506
131
3.0
130
79
9
421
26
9
9
54
1.63
21771581--21771646
26
2.4
27
80
12
73
31
3
3
62
1.26
21779511--21779581
16
4.4
16
78
3
81
39
7
23
29
1.81
21779828--21779860
17
1.9
17
100
0
66
63
0
0
36
0.95
21780008--21780049
19
2.2
18
91
8
66
28
4
9
57
1.51
21784791--21784827
16
2.1
19
85
14
53
59
5
0
35
1.20
21785196--21785281
3
28.3
3
72
17
63
63
1
4
30
1.21
21785196--21785278
12
6.8
12
76
11
71
63
1
4
30
1.22
21785196--21785282
27
3.4
27
70
13
76
64
1
4
29
1.21
21785582--21785629
26
1.9
25
87
8
71
54
20
2
22
1.55
21785818--21785848
4
7.8
4
100
0
62
22
0
0
77
0.77
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47
2.4
47
84
6
154
35
23
16
25
1.95
21795600--21795633
4
8.2
4
90
3
50
0
26
0
73
0.83
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12
4.2
12
75
19
59
48
2
0
48
1.12
21798049--21798092
17
2.6
18
78
10
56
47
2
0
50
1.13
21813244--21813302
26
2.3
25
85
5
75
45
18
15
20
1.85
21821605--21821630
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
21821632--21821686
28
1.9
28
82
10
67
49
5
10
34
1.61
21829303--21829366
33
1.9
33
96
0
119
15
9
42
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21831470--21832036
189
3.0
189
98
0
1107
29
19
15
34
1.93
21835272--21835373
43
2.3
43
82
11
120
50
11
21
15
1.76
21836320--21836519
102
2.0
102
97
0
382
21
13
18
46
1.83
21836969--21837226
129
2.0
129
90
1
401
34
19
15
30
1.93
21840062--21840153
28
3.2
28
72
13
80
60
2
2
34
1.21
21840650--21840710
31
2.0
31
96
0
113
45
6
8
39
1.60
21841130--21841205
27
2.8
27
82
7
91
23
23
26
26
2.00
21841141--21841207
27
2.5
27
90
0
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26
20
28
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1.99
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25
2.2
25
81
9
69
64
1
0
33
1.04
21846252--21846307
24
2.3
25
81
6
62
64
1
0
33
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378