Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  272  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
251
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21
18
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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20
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1.96
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20
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1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
28
46
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81824060--81824135
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1.97
81825150--81825317
40
4.2
40
89
2
239
25
19
21
33
1.97
81825396--81825514
40
2.7
44
72
15
120
26
19
21
33
1.97
81837042--81837092
26
2.0
26
84
3
68
64
3
0
31
1.11
81837054--81837102
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
81840228--81840267
14
3.1
13
86
10
55
62
5
0
32
1.17
81840349--81840380
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
81847231--81847263
14
2.4
14
100
0
66
33
0
12
54
1.37
81849160--81849335
46
3.8
46
79
12
216
21
21
28
28
1.98
81849157--81849327
93
1.8
93
96
0
315
21
21
28
28
1.99
81856781--81856838
29
2.0
29
100
0
116
34
6
27
31
1.83
81860661--81860791
34
3.6
34
72
16
102
32
22
19
26
1.97
81860628--81860797
74
2.3
75
81
3
200
32
20
20
27
1.97
81860659--81860762
34
2.9
35
73
18
104
33
22
20
24
1.97
81872280--81872356
31
2.5
31
85
6
95
46
9
11
32
1.72
81878601--81878752
40
3.8
40
77
6
119
23
21
28
26
1.99
81891465--81891617
40
3.8
40
81
4
164
23
22
28
25
2.00
81894350--81894396
23
2.0
23
95
0
85
51
25
4
19
1.65
81897304--81897366
31
2.0
31
100
0
126
25
25
12
36
1.91
81905626--81905663
20
1.9
20
84
10
51
68
0
10
21
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81905693--81905722
13
2.4
12
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5
51
76
0
23
0
0.78
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15
2.1
15
93
0
53
25
6
9
58
1.54
81907961--81908111
73
2.1
72
92
1
248
25
22
30
21
1.99
81909445--81909513
33
2.1
33
94
0
120
24
18
27
28
1.98
81915489--81915546
25
2.3
25
84
0
80
36
20
24
18
1.95
81916522--81916584
30
2.1
30
82
11
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30
15
0
53
1.42
81932757--81932808
20
2.6
20
78
0
59
46
13
7
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1.72
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21
2.1
21
86
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50
0
26
23
1.50
81941767--81941983
40
5.5
40
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264
23
27
23
24
2.00
81941767--81941987
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2.8
79
87
4
295
23
27
23
25
2.00
81949528--81949695
40
4.2
40
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1
194
24
27
22
25
2.00
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17
2.8
18
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22
50
24
18
22
34
1.96
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40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
81964241--81964289
17
2.8
18
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22
50
24
18
22
34
1.96
81965112--81965278
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4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
81969528--81969572
16
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17
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20
2
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1.20
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7
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7
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61
15
2
40
40
1.60
81975687--81976050
47
7.8
46
74
14
298
21
28
21
27
1.99
81975687--81976047
94
3.9
93
79
8
387
21
28
21
27
1.99
81975688--81976050
141
2.6
140
77
10
366
21
28
22
27
1.99
81976391--81976448
30
1.9
30
92
0
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27
25
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1.94
81984302--81984455
43
3.6
43
81
1
139
31
28
16
23
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81984348--81984448
42
2.4
42
84
1
121
33
28
14
22
1.94
81998751--81998928
48
3.7
48
81
10
188
23
30
18
26
1.98
81998798--81998934
46
3.0
44
82
10
159
25
29
17
27
1.97
82000285--82000337
10
5.7
10
80
17
69
58
0
1
39
1.09
82006790--82006825
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2.0
18
89
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44
0
27
27
1.55
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40
5.2
40
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193
25
24
25
24
2.00
82009651--82009856
80
2.6
80
82
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227
25
24
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202
25
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138
26
23
27
22
2.00
82025762--82025950
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378