Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  65  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17000246--17000302
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0
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0
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62
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
27
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3
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10
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0
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17023384--17023420
13
2.6
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51
37
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49
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17
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121
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17
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1.94
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1.94
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2.5
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0
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17
20
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57
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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426
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18
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1.93
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18
35
1.94
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76
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18
36
1.93
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17
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19
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1.92
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17
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2.0
30
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18
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25
5
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17054285--17054419
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2.6
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96
1
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36
25
5
33
1.78
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26
5.2
26
93
0
227
36
25
5
33
1.80
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10
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0
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12
50
1.71
17071033--17071085
3
18.3
3
81
14
67
73
0
26
0
0.83
17071036--17071085
5
9.8
5
81
14
50
74
0
26
0
0.83
17073056--17073885
132
6.3
132
88
1
1173
28
20
24
26
1.99
17073315--17073649
45
7.6
45
66
11
120
28
20
24
27
1.99
17073910--17074052
44
3.3
43
75
3
135
27
19
25
27
1.99
17073889--17074055
88
1.9
88
82
4
212
29
19
22
27
1.98
17088358--17088551
10
20.4
9
69
19
92
32
3
3
60
1.27
17088400--17088442
21
2.0
22
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4
70
37
0
6
55
1.27
17088454--17088517
18
3.5
17
75
12
56
31
0
1
67
1.00
17088472--17088525
26
2.0
28
86
10
78
31
0
0
68
0.90
17088474--17088578
8
11.4
9
70
20
67
32
1
1
63
1.16
17089223--17089299
17
4.5
17
77
8
66
58
2
3
35
1.30
17089833--17089857
13
1.9
13
100
0
50
48
8
4
40
1.51
17089830--17089880
15
3.5
15
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10
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1
54
1.30
17090413--17090480
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34
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0
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8
0
50
1.34
17091524--17091601
17
4.3
18
72
18
63
61
3
1
33
1.22
17091524--17091601
36
2.1
38
79
9
90
61
3
1
33
1.22
17092543--17092574
16
2.1
16
88
11
50
18
3
6
71
1.20
17093335--17093363
14
2.0
15
93
6
51
75
6
6
10
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17093940--17093982
9
4.9
9
82
2
52
37
0
2
60
1.10
17106999--17107034
15
2.5
14
86
8
54
25
13
0
61
1.33
17107014--17107335
107
3.0
107
93
1
518
31
13
16
38
1.87
17107027--17107335
161
1.9
162
93
0
539
31
13
17
37
1.88
17107027--17107335
54
5.7
54
94
1
521
31
13
17
37
1.88
17108535--17108563
14
2.0
15
93
6
51
75
6
6
10
1.17
17109162--17109204
9
4.9
9
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2
52
37
0
2
60
1.10
17110427--17110535
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4.2
26
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175
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5
23
36
1.78
17113783--17113829
24
2.0
23
83
4
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17
2
6
74
1.12
17113783--17113829
25
2.0
24
84
16
62
17
2
6
74
1.12
17113807--17113932
10
12.7
10
70
14
73
25
3
3
67
1.23
17113843--17113916
18
4.0
17
74
11
58
25
2
2
68
1.16
17113843--17113918
28
2.7
26
70
20
64
25
2
2
69
1.14
17113895--17113936
22
1.9
22
95
0
75
26
0
4
69
1.08
17114480--17114508
2
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2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
17116575--17116615
21
1.9
22
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5
57
19
2
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1.63
17118664--17118717
23
2.4
22
82
14
58
31
7
1
59
1.36
17118762--17118816
28
2.0
27
82
3
65
32
9
3
54
1.49
17122625--17122677
19
2.8
19
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5
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28
20
5
45
1.74
17130637--17130810
70
2.5
70
89
3
262
26
24
22
27
2.00
17130795--17131001
88
2.3
88
78
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222
29
18
24
27
1.98
17130783--17131149
45
7.9
45
69
12
179
30
19
22
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17133338--17133391
23
2.4
23
84
9
67
33
7
0
59
1.25
17133346--17133388
23
1.9
22
90
4
68
32
6
0
60
1.23
17133436--17133490
28
2.0
27
82
3
65
32
9
3
54
1.49
17145412--17145455
16
2.8
16
86
3
54
43
31
2
22
1.66
17145482--17145550
14
4.9
14
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15
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37
40
1
20
1.61
17146036--17146177
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3.6
42
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18
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21
2
33
42
1.65
17146093--17146165
21
3.5
21
75
7
85
20
2
32
43
1.66
17146078--17146148
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2.5
28
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22
1
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42
1.63
17146041--17146140
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34
88
5
146
23
2
32
43
1.65
17146383--17146584
84
2.4
84
80
4
212
30
14
24
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378