Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  58  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Score
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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Period
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A
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(0-2)
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13
3.8
13
72
12
50
19
0
33
47
1.50
14916126--14916176
20
2.5
20
74
0
57
19
0
33
47
1.50
14916381--14916414
18
1.9
18
88
5
52
50
2
2
44
1.32
14921317--14921527
43
4.8
43
84
4
262
26
18
22
32
1.97
14921327--14921492
42
3.9
42
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4
215
26
18
19
35
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14934076--14934206
64
2.0
64
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0
199
41
18
10
29
1.84
14936065--14936111
22
2.1
22
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7
60
29
0
19
51
1.47
14942137--14942173
5
7.6
5
93
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67
18
0
0
81
0.70
14943211--14943390
95
1.9
95
81
0
216
36
21
16
25
1.94
14945181--14945225
8
5.5
8
80
15
56
51
2
0
46
1.13
14945764--14945801
18
2.2
17
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13
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47
0
2
50
1.15
14945764--14945802
17
2.2
19
86
9
55
48
0
2
48
1.15
14948318--14948349
7
4.7
7
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3
57
15
84
0
0
0.63
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18
3.8
18
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30
7
25
36
1.84
14950363--14950434
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2.0
36
100
0
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19
36
22
22
1.95
14953181--14953264
30
2.8
31
74
18
86
44
11
13
30
1.79
14961606--14961651
21
2.2
21
96
0
83
21
28
10
39
1.87
14971643--14971739
28
3.5
28
63
8
72
35
1
13
50
1.48
14971653--14971765
52
2.1
55
90
4
178
38
0
16
43
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14973350--14973397
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2.0
23
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11
62
43
0
2
54
1.12
14977619--14977666
19
2.6
19
83
3
62
33
2
16
47
1.58
14977675--14977772
43
2.3
43
91
3
153
32
6
12
48
1.65
14982346--14982395
19
2.7
18
81
9
64
34
2
16
48
1.57
14982407--14982499
43
2.2
43
90
3
143
29
6
12
51
1.65
14986070--14986137
18
3.8
18
71
7
59
58
1
2
36
1.22
14987537--14987592
23
2.5
21
78
16
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3
5
26
1.32
14988720--14988770
21
2.5
22
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1
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10
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19
104
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4
2
34
1.29
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19
5.7
19
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20
68
58
3
1
35
1.26
14988837--14988934
28
3.6
25
72
16
72
59
4
1
35
1.23
14988788--14988933
36
3.9
36
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10
109
58
4
2
34
1.31
14989311--14989350
17
2.4
17
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0
53
35
0
0
65
0.93
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10
10.2
10
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25
1
6
68
1.19
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19
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20
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24
0
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1.12
14989320--14989411
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9.7
9
73
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25
0
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1.09
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27
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1
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1.25
14989660--14989765
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2.9
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74
14
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5
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31
1.30
14989741--14989813
19
3.9
18
77
16
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5
0
31
1.17
14989757--14989812
18
3.1
18
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10
53
62
5
0
32
1.18
14991830--14991886
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23
50
36
0
1
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1.07
14991825--14991886
25
2.3
26
86
8
81
38
0
1
59
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14991866--14991932
21
3.3
20
85
4
82
28
0
4
67
1.10
14991829--14991951
9
12.9
9
65
14
50
30
0
3
65
1.14
14991827--14991985
10
16.7
9
67
20
74
33
1
3
62
1.19
14993522--14993562
21
1.9
21
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5
55
43
2
0
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1.13
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2
15.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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2.0
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90
0
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7
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0
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29
0
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24
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0
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0
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17
1.46
15009552--15009582
15
2.1
15
100
0
62
32
25
0
41
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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