Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  276  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
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Number
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
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Indels
Score
A
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(0-2)
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1.82
83251931--83251989
27
2.2
27
100
0
118
42
3
11
42
1.58
83254829--83254870
18
2.5
17
81
11
59
69
4
9
16
1.33
83263753--83263796
18
2.6
16
82
10
61
72
2
9
15
1.19
83273602--83273650
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
83274468--83274674
40
5.2
40
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4
249
25
21
28
25
1.99
83281640--83281688
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
83282564--83282679
40
2.9
39
82
7
144
23
22
29
25
1.99
83286841--83286921
41
2.0
41
80
9
94
33
27
17
22
1.96
83290731--83290773
21
2.0
21
82
8
52
37
6
13
41
1.72
83290788--83290827
21
2.0
21
85
5
55
27
5
22
45
1.73
83292923--83293019
29
3.4
29
77
5
117
21
34
22
21
1.97
83293095--83293217
42
2.9
42
77
1
120
22
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17
21
1.93
83302888--83302923
2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
83308184--83308291
39
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40
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8
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33
18
23
25
1.97
83308378--83308432
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34
0
7
58
1.26
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28
2.1
29
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3
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26
1
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40
1.66
83308927--83309057
7
17.7
7
68
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18
1
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47
1.58
83309018--83309057
15
2.6
16
88
7
57
15
5
30
50
1.65
83311259--83311415
68
2.3
68
83
3
192
41
17
14
26
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83313734--83313870
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4.8
29
71
15
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28
31
18
21
1.97
83313734--83313900
56
2.9
58
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2
286
28
29
19
22
1.98
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29
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29
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10
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26
20
22
1.98
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43
2.8
43
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1
193
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33
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1.89
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0
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0
0
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1.00
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2.3
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201
41
18
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1.89
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25
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21
1.97
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1.32
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15
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0
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59
0
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0
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83332547--83332754
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27
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124
48
12
0
38
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1.9
105
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12
0
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30
2.5
33
76
9
87
14
2
19
62
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83338643--83338708
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2.2
31
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2
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3
18
60
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43
2.6
42
92
5
188
22
33
19
24
1.97
83339522--83339569
19
2.6
17
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15
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33
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4
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1.44
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9
42.1
9
70
9
129
45
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1.55
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31
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0
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130
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0
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24
2.0
24
84
11
64
32
22
46
0
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378