Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  81  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21847572--21847623
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1.88
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1.8
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2.0
23
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8
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55
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2
35
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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18
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21902212--21902256
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2.0
23
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2.1
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1
22
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2.4
42
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2.3
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2.8
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40
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1.58
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127
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15
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5
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1.37
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14
4.2
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44
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3
47
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21951209--21951257
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2.0
24
92
0
80
55
2
8
34
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.44
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36
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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26
2.5
26
82
17
74
20
6
2
69
1.25
22069271--22069345
37
2.0
37
97
0
141
21
26
16
36
1.94
22075676--22075730
22
2.5
21
82
8
74
27
5
0
67
1.12
22075702--22075831
63
2.1
63
85
2
172
28
7
0
63
1.27
22080367--22080391
12
2.1
12
100
0
50
44
24
8
24
1.80
22085798--22085844
23
2.0
23
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0
58
23
31
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36
1.85
22087148--22087184
6
6.3
6
93
6
67
29
0
0
70
0.88
22087148--22087185
11
3.4
11
89
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58
31
0
0
68
0.90
22088652--22088693
19
2.2
19
100
0
84
33
4
26
35
1.77
22088941--22089187
123
2.0
123
87
3
354
29
14
14
42
1.85
22102220--22102270
15
3.4
15
83
0
66
52
11
17
17
1.73
22105441--22105603
39
4.2
39
90
0
254
22
19
33
24
1.97
22105441--22105633
39
4.9
39
87
0
242
22
20
32
23
1.98
22125012--22126017
45
21.6
45
73
9
475
34
16
19
29
1.94
22125012--22126017
96
10.7
96
72
10
611
34
16
19
29
1.94
22125751--22125925
95
1.8
96
87
3
264
36
14
17
32
1.89
22125099--22126017
146
6.5
145
76
10
564
34
16
19
29
1.94
22126604--22126646
21
2.0
21
100
0
86
18
4
4
72
1.20
22127487--22127519
16
2.1
15
94
5
57
18
3
0
78
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22127488--22127533
23
2.0
24
82
4
58
17
8
0
73
1.07
22127580--22127634
23
2.5
22
77
13
58
25
3
3
67
1.23
22127612--22127725
59
1.9
59
87
5
167
28
7
1
63
1.30
22128403--22128455
27
2.0
27
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0
97
16
15
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1.90
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35
2.0
35
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0
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11
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1.79
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13
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16
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22
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16
7
11
1.46
22129805--22129872
30
2.3
30
92
0
109
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16
5
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1.42
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11
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11
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0
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1.00
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22
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66
0
54
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1.00
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2.5
17
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11
50
0
54
0
45
0.99
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2
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2
73
13
102
40
3
5
50
1.44
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2
18.5
2
88
0
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2
2
48
1.30
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70
8.2
70
91
6
906
32
16
20
31
1.95
22143032--22143608
139
4.1
140
91
7
906
32
16
20
31
1.95
22143032--22143608
215
2.7
215
93
5
970
32
16
20
31
1.95
22144399--22144503
35
3.0
35
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1
185
16
48
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22
1.79
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15
4.6
14
72
20
64
63
16
6
13
1.48
22144906--22144970
14
4.5
14
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16
71
63
16
6
13
1.50
22144899--22144973
30
2.4
32
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109
65
16
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12
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31
2.8
29
80
10
92
67
16
5
11
1.38
22145775--22145823
2
25.0
2
87
4
73
44
0
4
51
1.20
22146109--22146195
21
4.3
19
72
24
63
32
4
4
58
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22147311--22147415
26
4.2
26
97
2
189
31
5
26
36
1.80
22148990--22149128
27
5.2
27
78
10
153
20
24
21
33
1.97
22148994--22149128
54
2.5
53
89
4
193
20
24
20
34
1.97
22155200--22155306
26
4.2
26
96
1
198
30
6
26
36
1.82
22156480--22156509
8
3.8
8
90
0
51
43
26
26
3
1.70
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27
5.0
26
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12
162
17
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33
1.96
22156893--22157033
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2.7
53
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3
223
17
24
24
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39
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5
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0
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22
0
0
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0.77
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18
2.0
18
88
0
54
30
13
25
30
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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