Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  377  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112473471--112473570
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1.98
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21
2.4
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0
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0
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4.3
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28
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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100
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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22
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1.89
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1.92
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1.96
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22
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1.92
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22
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153
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20
18
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1.96
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2.1
75
85
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222
32
20
18
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
28
1.99
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212
2.9
208
81
10
652
35
21
16
26
1.95
112658288--112658453
72
2.3
71
88
4
244
41
21
15
22
1.89
112658328--112658826
122
4.0
122
81
11
586
37
23
14
24
1.92
112658453--112658713
69
3.8
70
83
8
345
37
22
14
24
1.92
112658291--112658878
260
2.3
254
93
4
991
36
22
14
25
1.93
112665571--112665605
11
3.0
12
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45
5
22
25
1.74
112667287--112667315
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
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10
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10
100
0
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0
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28
2.4
28
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5
71
6
6
15
72
1.24
112668189--112668223
16
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16
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10
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0
8
2
88
0.61
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20
2.5
20
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14
79
48
9
15
26
1.76
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2.0
30
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29
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29
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0
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40
1.69
112691065--112691163
48
2.1
48
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3
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41
7
11
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0
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2.8
46
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0
218
30
29
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19
1.97
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3.0
54
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1
203
24
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1.96
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2.1
41
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2
158
43
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20
1.85
112711220--112711255
18
2.1
16
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10
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5
2
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1.17
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2
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2
100
0
152
0
0
50
50
1.00
112713671--112713718
16
3.1
15
80
19
62
27
0
2
70
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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77
2.3
80
82
8
223
26
27
21
24
2.00
112719156--112719357
40
5.1
39
82
7
214
25
27
21
25
2.00
112722073--112722121
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3.1
15
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18
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28
0
2
69
1.00
112725932--112726070
54
2.6
55
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3
201
33
19
22
25
1.97
112726040--112726180
53
2.6
53
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29
17
21
31
1.96
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162
2.7
158
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9
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16
18
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1.93
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4.3
107
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1.93
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1.26
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0
0
0
100
0.00
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1.49
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2
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1.13
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0
7
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1.28
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3.4
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37
0
7
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1.37
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10.5
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0
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4
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45
0
0
54
0.99
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0
0
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0.95
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100
0
104
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0
0
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0.91
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1
0
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1.07
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19.5
2
100
0
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48
0
0
51
1.00
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2.0
13
100
0
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24
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112764307--112764345
16
2.5
16
87
4
53
58
2
0
38
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112764389--112764453
21
3.1
22
69
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55
49
3
6
41
1.43
112772537--112772593
26
2.2
26
81
6
62
33
1
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50
1.52
112772565--112772632
32
2.1
33
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2
93
26
1
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52
1.54
112775819--112775858
20
2.0
20
90
0
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13
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0
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2.0
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19
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1.9
23
90
4
70
69
6
0
23
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378