Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  34  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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0.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.8
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17
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17
17
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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0
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18
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61
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0
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23
1.9
22
85
14
59
26
2
0
70
0.99
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9
2.8
9
100
0
50
56
8
0
36
1.29
8593241--8593281
21
2.0
21
85
0
55
26
19
26
26
1.99
8596477--8596517
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
8599668--8599734
31
2.2
31
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7
84
22
10
19
47
1.79
8608884--8608914
14
2.2
14
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0
53
29
6
0
64
1.18
8608883--8608925
14
2.9
15
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6
52
30
4
4
60
1.37
8610381--8610414
6
6.0
6
86
13
54
0
14
0
85
0.60
8610381--8610414
17
2.0
17
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0
59
0
14
0
85
0.60
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26
1.9
26
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0
64
46
0
0
54
1.00
8636727--8636775
15
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24
4
10
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1.45
8644402--8644451
18
2.7
19
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9
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0
22
0.99
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16
2.1
16
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50
33
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0
57
1.30
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49
2.1
49
100
0
202
49
0
20
29
1.49
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13
2.0
13
100
0
52
38
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1.83
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22
2.0
22
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0
61
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0
0
47
1.00
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13
2.9
14
80
13
50
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
16
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13
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59
0
0
40
0.97
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19
1.9
19
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0
56
48
5
0
45
1.25
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14
2.8
14
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4
60
31
21
7
39
1.82
8665233--8665300
20
3.2
20
80
14
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44
2
16
36
1.63
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14
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0
4
18
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19
2.1
19
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0
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0
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1.44
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21
2.1
22
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25
4
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1.38
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0
0
58
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15
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2
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35
0
12
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1.39
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21
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13
20
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40
1.89
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115
1.9
115
92
0
372
48
8
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31
1.69
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2
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2
100
0
50
52
0
0
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1.00
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2.3
23
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41
1
9
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1.47
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17
1.9
18
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5
52
67
5
5
20
1.33
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2.1
28
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1
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24
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25
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1.9
49
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29
20
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3.0
49
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5
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30
20
10
38
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28
3.3
28
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18
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65
13
11
9
1.47
8693662--8693755
28
3.1
31
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20
90
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14
12
10
1.56
8693642--8693755
59
1.9
59
96
0
210
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14
12
10
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18
2.0
18
94
0
63
27
2
11
58
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8709491--8709545
25
2.2
25
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0
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18
29
20
32
1.96
8720522--8720554
12
2.6
13
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4
50
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3
0
18
0.87
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18
2.8
17
80
14
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38
0
6
56
1.24
8723715--8723784
30
2.3
31
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14
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38
7
1
52
1.38
8737458--8737496
17
2.3
18
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13
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35
7
2
53
1.43
8741933--8741991
26
2.4
24
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10
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3
0
28
1.06
8741962--8742007
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2.2
20
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4
0
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27.7
3
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3
3
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1.31
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10.0
3
100
0
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0
0
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27
3.2
26
80
15
79
31
4
3
60
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378