Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  347  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104571148--104571178
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0
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0
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41
0
17
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1.49
104577432--104577496
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0
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15
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5
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12
0
15
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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52
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2.3
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2
5
39
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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397
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1396
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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6
71
42
8
21
27
1.81
104687804--104687838
2
18.0
2
88
5
54
48
0
2
48
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12
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12
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50
58
4
0
37
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3
29.0
3
72
21
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65
1
3
29
1.16
104688210--104688286
29
2.8
26
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20
77
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3
28
1.17
104688200--104688286
38
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108
65
1
3
29
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104688615--104688665
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7
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104688621--104688688
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0
0
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0
25
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39
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2.3
22
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15
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0
0
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104693286--104693338
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0
0
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13
2.1
14
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6
51
17
6
6
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
50
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131
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133
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2.0
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155
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0
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0
0
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0
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27
4.2
27
73
19
96
53
3
5
37
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104775115--104775192
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5.8
13
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2
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2.2
64
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2
4
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1.36
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2.5
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13
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2
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2
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2
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4.2
28
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100
53
3
5
37
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378