Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  22  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5834528--5834559
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5.2
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1.84
5847610--5847707
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155
34
16
11
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21
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5849042--5849662
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21
22
30
1.98
5849042--5849660
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2.5
251
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2.2
17
100
0
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35
10
10
43
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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1.05
5859579--5859613
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1.9
18
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5876502--5876553
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2.0
26
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15
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5876802--5876975
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1.31
5876829--5876955
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1.9
68
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152
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2
37
1.24
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2
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5876876--5876943
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70
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1
41
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2.0
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3.4
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1.50
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44
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1.96
5878741--5879589
88
9.8
88
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1035
20
32
18
28
1.96
5878741--5879589
132
6.5
132
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1159
20
32
18
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1.96
5879074--5879133
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2.0
30
93
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2.0
74
91
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1.96
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2.2
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1.95
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237
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1.78
5884566--5884730
35
4.6
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249
37
9
13
38
1.78
5884566--5884730
53
3.1
54
88
4
246
37
9
13
38
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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0
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2.6
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10
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55
0
0
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0
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2.0
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5
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1.78
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5.2
26
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1.78
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1.17
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17
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73
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462
31
17
19
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5931865--5932531
147
4.2
149
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11
606
30
16
18
33
1.94
5932251--5932531
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3.5
74
76
17
190
30
15
18
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1.92
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30
2.0
29
90
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93
20
10
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1.84
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18
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19
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14
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24
1
6
1.19
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40
2.2
39
87
2
127
69
23
1
5
1.17
5933398--5933478
22
3.9
22
69
12
71
67
24
1
6
1.20
5934108--5934165
23
2.5
23
88
8
82
32
6
5
55
1.49
5939041--5939148
26
4.2
26
92
4
184
36
25
5
33
1.79
5939036--5939148
50
2.2
52
93
4
203
35
26
5
32
1.79
5941885--5942674
205
3.9
205
95
0
1352
29
18
22
29
1.98
5942728--5942813
44
2.0
43
84
6
111
29
16
29
25
1.97
5943245--5943293
24
2.1
24
88
7
75
38
4
20
36
1.72
5943253--5943303
24
2.1
24
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0
84
27
3
23
45
1.70
5943245--5943303
24
2.6
22
82
10
73
33
3
23
38
1.72
5943782--5943816
3
11.7
3
100
0
70
34
0
0
65
0.93
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3
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3
100
0
72
33
0
0
66
0.92
5944040--5944082
16
2.8
15
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59
30
6
0
62
1.21
5944186--5944217
16
2.0
16
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0
55
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21
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50
1.71
5944229--5944260
13
2.6
13
90
9
50
25
6
3
65
1.31
5944444--5944504
22
2.8
22
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2
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18
6
6
68
1.33
5944217--5944459
3
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3
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15
87
32
8
2
57
1.41
5948456--5948497
22
1.9
22
85
9
59
61
2
4
30
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5948519--5948610
3
30.3
3
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22
50
63
2
5
29
1.29
5948518--5948571
26
2.0
27
82
10
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64
3
5
25
1.32
5948567--5948676
12
9.3
12
67
18
54
58
3
3
34
1.33
5948565--5948633
18
3.9
17
77
17
61
60
1
4
33
1.25
5948576--5948674
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2.4
40
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4
3
35
1.33
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77
2.1
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81
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5
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1.42
5948746--5948852
24
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4
3
29
1.33
5948685--5948863
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23
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18
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5
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1.44
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3
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100
0
80
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0
0
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4.5
15
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20
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58
5
2
32
1.38
5950202--5950250
22
2.3
21
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22
2
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36
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25
1.9
25
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0
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12
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73
3.1
73
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7
292
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19
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30
1.92
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88
2.9
88
82
8
336
36
20
15
27
1.93
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14
2.1
14
100
0
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6
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13
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75
4.2
73
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409
33
21
17
28
1.96
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3
18.3
3
78
3
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64
0
3
31
1.11
5952809--5952839
15
2.1
15
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0
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0
6
32
1.21
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6
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0
0
17
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11
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7
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0
0
16
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17
2.1
17
100
0
72
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0
0
16
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5952931--5953024
21
4.4
21
77
5
89
67
1
6
25
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5953160--5953284
3
42.7
3
67
13
55
61
4
8
26
1.42
5953165--5953204
20
2.0
21
85
5
55
57
2
12
27
1.48
5953187--5953244
17
3.6
17
82
17
88
62
6
3
27
1.37
5953186--5953251
30
2.2
30
97
0
123
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6
3
25
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2.3
13
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5
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83
0
9
6
0.79
5954203--5954250
10
4.6
10
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53
83
2
8
6
0.88
5954870--5955077
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3
319
19
25
21
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1.96
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14.4
43
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8
401
20
22
21
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1.96
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19
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1.96
5954875--5955294
217
1.9
217
90
0
671
20
24
20
34
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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