Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  369  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110445352--110445434
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3
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30
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1
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1.17
110445352--110445434
18
4.4
18
79
13
87
30
3
1
65
1.17
110445351--110445438
27
3.3
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12
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30
3
1
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1.17
110449948--110450007
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3.5
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3
1.12
110449948--110450008
18
3.4
18
69
13
63
75
16
4
3
1.11
110449951--110450042
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3
1.12
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14
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76
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1.09
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514
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2.5
259
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14
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9
491
29
17
21
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1.96
110457567--110457997
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2.9
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1.96
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18
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1.93
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465
33
17
18
30
1.94
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2.1
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90
9
165
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1.95
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9.2
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75
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446
28
17
19
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1.95
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2.0
189
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10
492
32
16
17
33
1.92
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4.5
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75
11
270
28
17
19
34
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2.1
30
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19
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105
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5
4
1.17
110459885--110459965
29
2.8
30
89
10
125
74
16
6
3
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
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5
5
58
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37
1.9
38
81
13
89
58
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5
28
1.46
110466383--110466611
88
2.6
87
77
10
225
35
19
16
28
1.93
110466672--110466812
75
1.9
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221
29
21
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14
2.1
14
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0
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13
13
1.45
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2.0
88
90
4
275
36
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18
25
1.94
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12.8
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72
16
548
33
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16
27
1.95
110467368--110467402
14
2.5
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5.0
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1.94
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1.95
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14
456
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17
28
1.96
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154
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638
33
22
16
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1.95
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13
2.5
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55
5
20
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1.62
110466747--110468207
650
2.3
641
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1969
34
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17
26
1.95
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15
2.4
15
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54
50
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19
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15
2.6
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30
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0
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20.3
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93
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65
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0
34
0.93
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1.9
13
100
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16
16
1.44
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188
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20
16
30
1.95
110475064--110475301
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3.6
67
85
10
294
30
21
16
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
71
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16
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1.96
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2.4
156
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645
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17
29
1.96
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17.3
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96
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97
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0
0
33
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2.8
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1
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2.0
103
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9
42
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0
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2.0
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4
6
36
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
32
1.56
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19
2.6
18
83
9
53
2
27
2
68
1.11
110527756--110527794
3
12.7
3
94
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66
0
0
33
0.92
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31
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0
103
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15
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1.76
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2
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2
100
0
66
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0
0
48
1.00
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0
0
37
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1.9
19
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0
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5
0
37
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110545497--110545547
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17
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16
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0
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20
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1.71
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132
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35
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17
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10
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1.01
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20
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0
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0
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0
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0
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110553990--110554030
2
20.5
2
100
0
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0
0
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0
0
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1.9
13
100
0
50
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0
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
16
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0
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0
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3
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2
1
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110590636--110590729
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20.4
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2.6
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0
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26
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2.2
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1.07
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0
0
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0
1
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15
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16
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0
0
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0
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4.3
6
100
0
52
46
19
34
0
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110602924--110602973
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2.6
20
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1.38
110604494--110604619
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2.4
53
91
1
200
52
12
5
29
1.62
110604494--110604620
53
2.4
53
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2
184
52
12
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1.61
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12
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5
0
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3
0
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19
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1
1
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110607315--110607367
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2.1
54
100
0
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23
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29
32
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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