Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  53  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
16
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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11
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78
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123
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0
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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17
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1.25
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12.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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20
9
0
69
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3
83
38
1
0
59
1.08
13405034--13405115
26
3.2
26
94
0
146
36
25
6
31
1.81
13412084--13412165
26
3.2
26
94
0
146
36
25
6
31
1.81
13414302--13414657
176
2.0
176
98
0
694
37
8
17
36
1.81
13416950--13417081
40
3.4
39
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7
115
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23
15
26
1.95
13416950--13417081
41
3.4
37
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13
88
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23
15
26
1.95
13426882--13426908
13
2.1
13
100
0
54
14
14
29
40
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13434383--13434414
7
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7
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0
55
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0
9
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2.1
31
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0
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24
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2.0
31
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0
97
29
27
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1.98
13439465--13439535
21
3.4
21
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1
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25
5
21
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1.72
13439744--13439784
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2.0
19
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13
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0
9
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0
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0
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1.00
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24
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15
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18
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34
2.0
34
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3.7
46
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14
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22
21
27
28
1.99
13450962--13451131
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1.8
93
94
1
306
21
21
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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46
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13
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21
21
27
28
1.99
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1.8
93
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0
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21
28
27
1.99
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37
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2.5
44
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1.97
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1.96
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1.94
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0
0
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0
0
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2.7
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0
0
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14
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25
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14
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20
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17
17
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20
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587
26
17
19
36
1.94
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2.3
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13
3.4
13
87
6
72
13
11
6
68
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13484124--13484409
100
2.9
101
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2
400
24
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18
38
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4.2
73
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383
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16
19
34
1.94
13484427--13484715
146
2.0
147
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17
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9
467
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16
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1.92
13484648--13485135
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5.4
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422
28
16
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18
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30
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1
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13493989--13494031
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1.9
24
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13
65
32
2
0
65
1.06

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378