Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  124  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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12
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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22
24
29
23
1.99
34894971--34895088
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
34894939--34895101
71
2.3
71
98
1
319
35
17
27
19
1.94
34902542--34902659
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
34902510--34902673
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
34913989--34914029
18
2.3
18
87
8
57
26
39
19
14
1.90
34917312--34917338
6
4.5
6
100
0
54
14
33
0
51
1.43
34922846--34922994
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
34922887--34922994
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
34930955--34931103
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
34930996--34931103
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
34935944--34935999
28
2.0
28
82
0
67
26
28
23
21
1.99
34939866--34939952
27
3.2
27
82
9
115
18
24
22
34
1.96
34939866--34939970
27
3.9
26
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7
104
20
24
20
34
1.96
34941905--34942041
39
3.5
39
82
0
184
36
11
10
40
1.77
34943327--34943383
21
2.7
20
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10
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52
3
0
43
1.18
34943343--34943404
30
2.1
28
85
5
79
50
6
1
41
1.38
34945915--34946001
32
2.7
32
87
0
129
27
28
19
24
1.98
34960511--34960694
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
34960555--34960703
80
1.9
80
81
2
183
22
24
30
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34965681--34965850
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1.8
92
96
0
313
27
29
21
21
1.99
34965676--34965847
46
3.7
46
79
14
210
28
28
21
21
1.99
34965674--34965866
46
4.2
47
74
13
168
27
29
20
21
1.98
34966263--34966322
30
2.0
30
90
0
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30
25
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36
1.85
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3.7
46
78
10
188
29
27
20
22
1.99
34973232--34973402
93
1.8
93
91
0
279
28
28
21
21
1.98
34973822--34973881
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2.0
30
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0
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30
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1.85
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2.0
16
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0
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1.49
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50
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28
25
18
27
1.98
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151
2.6
151
92
0
651
29
24
18
27
1.98
34984607--34985001
101
3.9
100
80
5
411
28
25
18
27
1.98
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2.3
20
82
10
60
48
14
0
36
1.44
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37
2.3
36
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5
147
26
33
19
20
1.97
34987245--34987640
49
8.1
49
97
0
684
27
26
11
34
1.91
34994024--34994066
21
2.0
21
100
0
86
41
9
9
39
1.69
34994170--34994201
16
2.0
16
93
0
55
34
18
0
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1.49
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50
6.6
50
77
7
323
30
25
16
28
1.96
34994512--34994786
151
1.8
151
95
0
505
30
25
17
26
1.97
34994470--34994795
101
3.3
98
75
11
297
30
25
16
27
1.97
34994512--34994793
50
5.6
50
76
11
240
30
25
17
26
1.98
34994409--34994793
201
1.9
200
86
5
553
30
24
17
27
1.97
34995408--34995463
30
1.9
30
85
3
78
25
25
10
39
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35001450--35001706
122
2.1
122
88
2
372
25
23
25
24
2.00
35001642--35001774
44
3.1
42
86
7
169
24
15
33
27
1.94
35001855--35001915
31
2.0
31
90
0
95
55
21
8
14
1.65
35003570--35003719
41
3.7
41
86
1
230
28
27
22
22
1.99
35011828--35011977
41
3.7
41
85
1
221
28
28
23
20
1.99
35012396--35012425
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
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13
2.1
14
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6
51
55
10
0
34
1.34
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2.5
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1
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22
24
21
1.99
35019389--35019539
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99
35019386--35019571
40
4.7
39
77
11
157
28
22
25
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378