Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  319  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97014751--97014892
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97018991--97019102
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20
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29
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36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.10
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12
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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18
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18
100
0
70
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11
25
40
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16
2.0
15
93
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53
58
0
0
41
0.98
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35
2.0
35
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0
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17
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39
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2.1
32
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96
54
7
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28
1.60
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18
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2
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0
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21
1.91
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20
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14
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21
1.90
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19
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3
0
33
1.12
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18
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0
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50
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3.8
46
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0
292
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13
23
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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27
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26
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136
2.1
137
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0
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1.98
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1.92
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55
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0
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0
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0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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50
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0
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97381727--97381778
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38
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1.21
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30
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30
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1.8
93
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22
19
27
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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