Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  334  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
2.00
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224
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25
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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29
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26
26
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2
2
75
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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17
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1.95
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1.9
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0
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6.4
24
92
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27
21
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
21
21
29
1.99
101589565--101589715
47
3.2
48
90
5
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27
21
21
29
1.99
101589764--101589830
20
3.3
20
93
0
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32
20
11
34
1.90
101589764--101589819
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1.9
25
91
0
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25
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1
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0
1
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101594286--101594347
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2.00
101632700--101632917
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2.00
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0
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1.00
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27
2.2
27
78
0
66
18
21
20
40
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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44
2.5
45
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1
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1.94
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2.0
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2.0
42
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0
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28
1.92
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0
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1.93
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1.78
101707231--101707406
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54
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0
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134
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21
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1.96
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6
19.8
6
70
18
81
19
15
15
49
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101708710--101708850
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4.5
31
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1
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19
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51
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101708752--101708809
19
3.4
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30
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17
48
1.82
101708827--101708859
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1.9
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0
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21
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1.75
101710744--101710781
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2.9
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19
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16
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9.2
27
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2
320
42
8
20
28
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378