Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  327  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.84
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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(0-2)
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39
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99598925--99599079
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25
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93
5
281
18
28
18
34
1.95
99611112--99611275
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
99611112--99611309
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
99618657--99618843
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
99618680--99618843
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
99618680--99618877
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
99622358--99622389
8
4.0
8
91
0
55
46
25
25
3
1.67
99622805--99622916
27
4.2
26
83
7
134
16
23
23
37
1.93
99622805--99622916
54
2.1
54
89
3
172
16
23
23
37
1.93
99628540--99628572
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
99628853--99628877
5
5.0
5
100
0
50
40
0
0
60
0.97
99630559--99630625
28
2.4
28
87
5
100
23
4
34
37
1.75
99630941--99630991
27
1.9
26
84
4
66
17
27
19
35
1.94
99631466--99631493
9
3.1
9
100
0
56
21
0
0
78
0.75
99636377--99636453
6
13.7
6
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8
74
15
5
1
77
1.00
99636375--99636452
21
3.5
22
83
13
90
16
5
1
76
1.02
99636375--99636451
27
2.8
27
80
20
97
16
5
1
76
1.03
99656773--99656856
26
3.2
26
81
9
100
29
16
13
40
1.86
99656997--99657031
12
2.8
13
87
12
56
17
14
0
68
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99657823--99657928
53
2.0
53
100
0
212
37
16
18
26
1.93
99659353--99659495
27
5.4
27
74
6
94
42
16
14
25
1.87
99659477--99659661
27
6.9
27
93
1
248
20
17
21
41
1.90
99663062--99663094
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
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13
2.2
13
100
0
58
31
0
13
55
1.39
99669980--99670022
6
7.5
6
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10
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13
2
0
83
0.74
99669980--99670032
11
4.7
11
81
4
61
16
3
0
79
0.88
99669980--99670032
17
3.1
17
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0
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16
3
0
79
0.88
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100
0
58
31
0
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1.39
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34
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0
139
21
11
30
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1.90
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49
2.6
49
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3
173
21
26
21
30
1.98
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46
3.7
46
85
6
222
22
27
19
30
1.98
99682768--99682939
94
1.8
93
88
3
265
22
27
19
30
1.98
99683311--99683349
19
2.1
19
100
0
78
20
15
5
58
1.55
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2
19.0
2
88
5
58
45
0
2
51
1.15
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13
3.5
13
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0
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15
33
35
15
1.89
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2.0
79
96
0
289
29
18
15
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1.92
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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0
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16
13
13
55
1.69
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9
3.8
9
100
0
68
20
0
67
11
1.21
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2
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2
100
0
106
49
0
50
0
1.00
99727917--99727962
22
2.1
22
95
0
83
32
17
13
36
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99728534--99728569
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
99731191--99731223
17
1.9
17
100
0
66
18
12
0
69
1.18
99732681--99732756
38
2.0
37
84
2
98
30
22
10
36
1.88
99732681--99732784
37
2.8
37
82
4
111
29
23
10
36
1.88
99733632--99733673
19
2.2
19
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4
66
57
2
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33
1.39
99733704--99733758
27
2.0
27
86
6
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60
1
1
36
1.18
99733839--99733898
9
6.3
9
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16
50
60
1
3
35
1.23
99733832--99733888
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2.7
21
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63
0
3
33
1.12
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19
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10
67
61
0
3
35
1.14
99734089--99734208
10
12.6
9
69
23
59
31
3
2
62
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378