Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  316  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0.76
96180423--96180468
12
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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30
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295
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21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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21
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1.98
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21
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28
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39
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30
27
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96334319--96334374
20
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63
0
0
36
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2.4
17
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2
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10
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17
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59
2
2
35
1.27
96334891--96334953
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27
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3
36
1.31
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24
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0
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1.74
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23
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1.42
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19
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0
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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0
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2.0
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1.13
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1.13
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1.03
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0
1
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33
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21
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45
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18
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13
180
34
10
16
38
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96405160--96405612
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46
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20
23
14
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1.89
96405160--96405612
185
2.4
185
89
1
683
20
23
14
41
1.89
96405160--96405604
139
3.2
139
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1.89
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2.3
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0
0
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20
26
26
1.99
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2.6
41
81
8
121
23
20
26
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378