Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  304  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92094460--92094539
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30
65
23
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1.93
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3.3
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22
66
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16
20
31
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1.9
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15
20
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1.94
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92106108--92106328
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287
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27
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4.1
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20
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1.98
92130799--92130946
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18
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0
15
51
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92134759--92134892
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64
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0
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2.0
24
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241
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2.0
39
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20
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0
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4.1
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52
22
0
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2.0
25
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4.2
40
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176
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22
25
2.00
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1.9
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198
23
27
22
25
2.00
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2.1
53
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37
1.92
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4.2
40
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176
24
27
22
25
2.00
92176826--92176976
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1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
92191121--92191439
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3.3
95
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329
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1.98
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1.9
144
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3
363
24
30
17
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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2.6
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3
6
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2.0
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2.0
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2.0
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1.59
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29
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16
25
1.96
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1.8
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87
0
235
25
31
16
25
1.96
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6.6
29
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231
25
32
16
25
1.96
92218919--92219107
86
2.2
87
82
4
231
25
32
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1.96
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16
12
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2.3
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11
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2
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0
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94
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2
266
39
18
17
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92253742--92253783
21
2.0
21
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1
0
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78
50
0
3
45
1.19
92269605--92269659
28
2.0
28
82
7
67
50
0
3
45
1.19
92270513--92270569
3
19.0
3
100
0
114
33
66
0
0
0.92
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11
3.2
11
87
0
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37
0
0
62
0.95
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3
14.7
3
85
4
61
62
0
2
34
1.08
92278182--92278227
17
2.7
18
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10
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56
0
2
41
1.11
92278910--92278949
14
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15
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14
50
75
5
10
10
1.19
92280048--92280157
37
3.0
37
90
0
166
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30
19
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1.98
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47
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47
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0
434
26
29
11
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1.92
92280504--92280575
22
3.1
22
64
24
58
23
29
13
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1.93
92283905--92284085
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2.0
92
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7
208
26
22
18
32
1.97
92285189--92285239
25
2.0
25
100
0
102
31
37
11
19
1.88
92289100--92289149
18
2.5
19
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15
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50
4
2
44
1.32
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0
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22
0
1.47
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29
2.0
29
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0
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17
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0
2
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1.10
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58
0
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37
1.16
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4.5
46
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203
25
28
17
28
1.97
92331785--92332153
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12
239
26
28
17
27
1.98
92340343--92340527
40
4.7
40
82
6
216
24
21
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
79
77
13
230
26
20
27
25
1.99
92348359--92348543
40
4.7
40
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7
218
23
21
28
26
1.99
92348359--92348541
79
2.3
81
84
7
232
24
21
27
26
1.99
92348360--92348576
79
2.7
78
78
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228
25
21
27
25
1.99
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2.0
80
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2
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1.81
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2.0
37
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0
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1.34
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179
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26
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1.97
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85
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20
1.95
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1.39
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0
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1.00
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2.3
19
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0
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27
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29
1.94
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0
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0
0
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2
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1
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1.28
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43
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100
0
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0
0
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0
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23
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1.97
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2.3
19
81
11
56
48
0
13
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1.8
269
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18
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26
3.2
26
91
0
139
32
6
24
37
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92409707--92409745
18
2.2
18
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13
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76
2
15
5
1.06
92411500--92411537
9
4.5
8
87
12
58
73
0
0
26
0.83
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18
2.4
18
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0
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0
2
27
1.00
92411501--92411549
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2.9
17
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2
0
30
1.02
92411545--92411630
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3.0
28
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3
3
30
1.28
92411552--92411642
28
3.1
27
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12
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2
2
30
1.17
92411499--92411642
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2.5
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2
2
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0
0
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0
0
71
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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